More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5012 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  495  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  93.31 
 
 
254 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  66.12 
 
 
279 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  66.67 
 
 
276 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  64.52 
 
 
272 aa  310  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  63.97 
 
 
295 aa  310  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  64.52 
 
 
268 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.37 
 
 
256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.2 
 
 
274 aa  296  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.905308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  62.8 
 
 
252 aa  295  4e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64 
 
 
293 aa  294  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2751  ABC transporter related  62.14 
 
 
249 aa  287  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2589  ATP-binding transport protein NatA  61.54 
 
 
266 aa  285  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.408024  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  59.52 
 
 
254 aa  279  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  58.66 
 
 
259 aa  279  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  55.69 
 
 
306 aa  277  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  60.16 
 
 
257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  53.2 
 
 
301 aa  271  6e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  55.28 
 
 
261 aa  268  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3107  ABC transporter related  61.13 
 
 
297 aa  257  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000121464  hitchhiker  0.00525293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 
259 aa  249  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  52.82 
 
 
253 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  52.61 
 
 
255 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  52.21 
 
 
255 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  45.38 
 
 
249 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 
249 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  36.51 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.19 
 
 
312 aa  181  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
256 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  38.14 
 
 
257 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
253 aa  177  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  43.1 
 
 
250 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  40.36 
 
 
337 aa  175  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  43.75 
 
 
253 aa  174  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.6 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  36.95 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  33.62 
 
 
249 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  34.18 
 
 
241 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  38.81 
 
 
236 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  40.83 
 
 
246 aa  167  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  40.27 
 
 
328 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  41.47 
 
 
316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  39.84 
 
 
279 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
241 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
241 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.59 
 
 
311 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 
241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 
241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  37.83 
 
 
242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
241 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  35.53 
 
 
241 aa  165  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 
244 aa  164  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  42.34 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  37.44 
 
 
327 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0710  ABC transporter related  38.08 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  36.96 
 
 
238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2857  ABC transporter, ATP-binding protein  34.45 
 
 
247 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00741343  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  41.23 
 
 
329 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  33.03 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  32.43 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  32.43 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  35.81 
 
 
241 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  39.09 
 
 
247 aa  162  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  35.63 
 
 
414 aa  162  6e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  33.33 
 
 
250 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  33.33 
 
 
250 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 
312 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 
312 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  31.98 
 
 
312 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  40.85 
 
 
325 aa  161  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 
312 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 
312 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  38.11 
 
 
247 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  37.61 
 
 
310 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
252 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  34.02 
 
 
257 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  38.36 
 
 
305 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.37 
 
 
331 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1289  ABC transporter related  38.43 
 
 
242 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.077287  hitchhiker  0.00948798 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  34.6 
 
 
239 aa  159  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  37.29 
 
 
244 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  40.95 
 
 
248 aa  159  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  40.37 
 
 
302 aa  158  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.59 
 
 
305 aa  158  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  38.35 
 
 
356 aa  158  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  41.63 
 
 
331 aa  158  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  38.87 
 
 
249 aa  158  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  36.21 
 
 
328 aa  158  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  39.73 
 
 
310 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  37.99 
 
 
310 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.63 
 
 
330 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  38.67 
 
 
332 aa  156  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  37.34 
 
 
247 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>