More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2857 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2857  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
247 aa  507  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00741343  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  64.85 
 
 
238 aa  329  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0710  ABC transporter related  60.76 
 
 
239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1289  ABC transporter related  59.07 
 
 
242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.077287  hitchhiker  0.00948798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1457  ABC transporter related  57.87 
 
 
241 aa  294  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1004  ABC transporter related  55.17 
 
 
237 aa  277  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00470286 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0830  ABC transporter related protein  52.5 
 
 
226 aa  229  4e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2701  ABC transporter related  49.05 
 
 
241 aa  225  6e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128649  normal  0.0320572 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3071  ABC transporter related protein  50.71 
 
 
252 aa  222  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5208  ABC transporter related protein  49.29 
 
 
259 aa  219  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0352  ABC transporter related  45.71 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  38.27 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
245 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  38.64 
 
 
310 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  37.45 
 
 
325 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  32.26 
 
 
259 aa  168  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  38.46 
 
 
252 aa  167  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  37.02 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  35.51 
 
 
259 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  36.78 
 
 
242 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 
305 aa  165  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 
252 aa  163  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  34.45 
 
 
254 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.89 
 
 
279 aa  162  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  38.91 
 
 
246 aa  162  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0090  ABC transporter-like protein  40.99 
 
 
312 aa  161  7e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.101268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  32.62 
 
 
272 aa  161  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  35.42 
 
 
344 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  36.33 
 
 
247 aa  161  9e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  33.19 
 
 
254 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 
301 aa  160  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.33 
 
 
295 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.47 
 
 
256 aa  159  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  37.24 
 
 
247 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  34.26 
 
 
257 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 
241 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 
244 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 
241 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 
241 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 
241 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.85 
 
 
305 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 
241 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  38.01 
 
 
316 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 
241 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 
241 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.16 
 
 
316 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  36.21 
 
 
247 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 
241 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  32.91 
 
 
268 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  33.49 
 
 
282 aa  155  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.91 
 
 
293 aa  155  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 
244 aa  154  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  38.46 
 
 
315 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  35.83 
 
 
250 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
308 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 
249 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  35.83 
 
 
250 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  34.47 
 
 
255 aa  153  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  37.79 
 
 
322 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.84 
 
 
337 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  35.12 
 
 
240 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  37.56 
 
 
369 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  31.76 
 
 
276 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  37.3 
 
 
241 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  34.45 
 
 
328 aa  153  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  35.91 
 
 
360 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  32.5 
 
 
328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  37.91 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  32.08 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  35.12 
 
 
241 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  36.59 
 
 
259 aa  152  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.44 
 
 
321 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  35.32 
 
 
301 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  36.6 
 
 
320 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  34.87 
 
 
239 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  36.6 
 
 
320 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  37.5 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  32.63 
 
 
257 aa  151  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  37.4 
 
 
256 aa  151  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  37.91 
 
 
308 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  36.73 
 
 
306 aa  151  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  36.1 
 
 
249 aa  151  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  36.74 
 
 
331 aa  151  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  34.12 
 
 
309 aa  151  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  32.78 
 
 
246 aa  151  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
314 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  38.18 
 
 
319 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  36.11 
 
 
279 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  37.02 
 
 
305 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  34.04 
 
 
237 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  31.8 
 
 
246 aa  150  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  32.62 
 
 
306 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  33.76 
 
 
250 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.86 
 
 
312 aa  149  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  31.65 
 
 
237 aa  149  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  35.44 
 
 
236 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.92 
 
 
309 aa  149  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  35.34 
 
 
287 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  35.08 
 
 
241 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  35.44 
 
 
318 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>