More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0710 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0710  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1289  ABC transporter related  68.49 
 
 		 242 aa  355  3.9999999999999996e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.077287  hitchhiker  0.00948798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1457  ABC transporter related  70.54 
 
 		 241 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1004  ABC transporter related  66.1 
 
 		 237 aa  334  5.999999999999999e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00470286 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  66.38 
 
 		 238 aa  325  5e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2857  ABC transporter, ATP-binding protein  60.76 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00741343  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0352  ABC transporter related  47.6 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2701  ABC transporter related  46.29 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128649  normal  0.0320572 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5208  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3071  ABC transporter related protein  46.44 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0830  ABC transporter related protein  47.74 
 
 		 226 aa  202  5e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  40 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  37.65 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  37.18 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.45 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  38.08 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  35.32 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  35.39 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  34.33 
 
 		 246 aa  162  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.62 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  34.57 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  36.65 
 
 		 344 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  37.72 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  34.73 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  37.18 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 		 301 aa  155  4e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  37.67 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  34.8 
 
 		 319 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.62 
 
 		 316 aa  154  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  38.89 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.92 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  35.91 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  35.59 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  34.39 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  34.39 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  35.84 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  37 
 
 		 310 aa  153  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  34.07 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0090  ABC transporter-like protein  38.14 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.101268 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  33.9 
 
 		 316 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  36.2 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  39.55 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  35.42 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.42 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  37.89 
 
 		 325 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  34.84 
 
 		 331 aa  151  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  34.47 
 
 		 241 aa  151  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  35.27 
 
 		 309 aa  151  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  32.89 
 
 		 282 aa  151  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  33.62 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  37.91 
 
 		 283 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  35.87 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  32.49 
 
 		 272 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  34.57 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  34.45 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  32.89 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  34.04 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.04 
 
 		 295 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  35.43 
 
 		 328 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  33.78 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 		 308 aa  148  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  35.94 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  34.39 
 
 		 328 aa  148  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  35.94 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  35.43 
 
 		 328 aa  148  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  33.03 
 
 		 252 aa  148  7e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  33.48 
 
 		 252 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.42 
 
 		 328 aa  148  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.62 
 
 		 324 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.07 
 
 		 334 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  33.48 
 
 		 306 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  35.44 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  34.2 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.62 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  34.39 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  33.49 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 		 325 aa  146  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  37.91 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.19 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.39 
 
 		 328 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  34.68 
 
 		 261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.64 
 
 		 326 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.14 
 
 		 309 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  35.55 
 
 		 320 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  36.06 
 
 		 319 aa  145  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.78 
 
 		 293 aa  145  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  35.78 
 
 		 307 aa  145  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2704  ABC transporter related  34.06 
 
 		 312 aa  145  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  34.84 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>