More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2592 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  100 
 
 
268 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  85.98 
 
 
272 aa  451  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  76.02 
 
 
279 aa  381  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  70.34 
 
 
295 aa  368  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  74.49 
 
 
276 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  71.02 
 
 
274 aa  351  7e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.905308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2751  ABC transporter related  68.57 
 
 
249 aa  338  5e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  62.86 
 
 
306 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  66.53 
 
 
254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  64.52 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.31 
 
 
293 aa  305  6e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  57.66 
 
 
301 aa  302  5.000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.24 
 
 
256 aa  297  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  59.27 
 
 
254 aa  289  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  58.87 
 
 
252 aa  281  8.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  54.51 
 
 
261 aa  278  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2589  ATP-binding transport protein NatA  59.51 
 
 
266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.408024  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  58 
 
 
257 aa  270  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  55.24 
 
 
259 aa  265  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3107  ABC transporter related  57.51 
 
 
297 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000121464  hitchhiker  0.00525293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  46.75 
 
 
253 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  48.99 
 
 
255 aa  221  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  42.58 
 
 
259 aa  221  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  48.58 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 
249 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  40.17 
 
 
259 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  39.33 
 
 
257 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  41.91 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  37.34 
 
 
236 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  42.92 
 
 
253 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  33.19 
 
 
253 aa  176  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  37.19 
 
 
251 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  38.17 
 
 
247 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.64 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  32.62 
 
 
237 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  36.1 
 
 
250 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  37.92 
 
 
246 aa  170  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  33.47 
 
 
249 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  36.1 
 
 
250 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  39.84 
 
 
258 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  40.76 
 
 
250 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 
242 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  32.26 
 
 
250 aa  168  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  35.02 
 
 
239 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  34.29 
 
 
246 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  36.64 
 
 
241 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  37.45 
 
 
247 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  38.14 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  39.58 
 
 
279 aa  165  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  38.36 
 
 
325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  39.46 
 
 
327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  33.99 
 
 
414 aa  164  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 
241 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  32.92 
 
 
241 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  32.92 
 
 
241 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 
241 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 
241 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  36.97 
 
 
328 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  39.45 
 
 
301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  37.29 
 
 
244 aa  162  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  33.33 
 
 
241 aa  161  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  37.71 
 
 
244 aa  161  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 
244 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  31.36 
 
 
241 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 
241 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  38.56 
 
 
244 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  38.56 
 
 
244 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  37.71 
 
 
244 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  35.81 
 
 
311 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
305 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  35.15 
 
 
243 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  33.95 
 
 
319 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  38.14 
 
 
244 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  34.41 
 
 
252 aa  159  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  38.56 
 
 
244 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  35.81 
 
 
328 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  32.77 
 
 
247 aa  159  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  38.14 
 
 
244 aa  158  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  34.98 
 
 
306 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  37.35 
 
 
512 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.84 
 
 
339 aa  158  8e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  37.96 
 
 
301 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  37.29 
 
 
244 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  31.85 
 
 
274 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  35.68 
 
 
247 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  36.44 
 
 
244 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1367  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  33.47 
 
 
245 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0150774  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 
248 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  35.21 
 
 
328 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  33.89 
 
 
243 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  37.38 
 
 
296 aa  156  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  38.99 
 
 
356 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  38.65 
 
 
328 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 
353 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  38.96 
 
 
248 aa  156  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  37.72 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>