More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0254 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  491  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  70.85 
 
 
247 aa  361  7.0000000000000005e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  69.2 
 
 
250 aa  344  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  69.2 
 
 
250 aa  344  1e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  65.06 
 
 
249 aa  341  5.999999999999999e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  48.8 
 
 
257 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  47.6 
 
 
259 aa  244  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  48.74 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  49.16 
 
 
252 aa  230  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  50 
 
 
250 aa  224  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  46.15 
 
 
239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  43.65 
 
 
259 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  45.83 
 
 
253 aa  218  8.999999999999998e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  47.39 
 
 
256 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  44.4 
 
 
241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  44.4 
 
 
241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
241 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 
241 aa  210  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 
241 aa  210  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  43.98 
 
 
241 aa  209  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  41.39 
 
 
245 aa  209  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  43.15 
 
 
241 aa  209  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 
241 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  45.33 
 
 
241 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  44.03 
 
 
242 aa  208  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  43.57 
 
 
244 aa  207  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  43.57 
 
 
241 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  43.37 
 
 
258 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  41.87 
 
 
247 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  46.64 
 
 
240 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  43.78 
 
 
327 aa  199  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  39.58 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  42.37 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  45.09 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.88 
 
 
334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  41.45 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  41.6 
 
 
241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  43.75 
 
 
303 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  40.59 
 
 
247 aa  195  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  45.54 
 
 
313 aa  195  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  40.59 
 
 
279 aa  193  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  40.74 
 
 
253 aa  193  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
313 aa  192  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 
541 aa  192  4e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  38.24 
 
 
259 aa  192  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.32 
 
 
333 aa  191  7e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  41.06 
 
 
308 aa  191  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  43.82 
 
 
290 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  43.84 
 
 
325 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 
243 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  40.85 
 
 
236 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  40.65 
 
 
308 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  39.5 
 
 
249 aa  188  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
305 aa  188  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.4 
 
 
243 aa  188  7e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  39.75 
 
 
238 aa  188  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.55 
 
 
309 aa  187  9e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  40.43 
 
 
238 aa  188  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 
238 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  43.32 
 
 
332 aa  186  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.23 
 
 
318 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  40.65 
 
 
510 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  39.75 
 
 
318 aa  186  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.64 
 
 
321 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  39.66 
 
 
314 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  40.34 
 
 
253 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  39.91 
 
 
315 aa  185  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  35.22 
 
 
337 aa  185  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 
249 aa  185  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  37.45 
 
 
594 aa  185  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.11 
 
 
279 aa  184  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  40.27 
 
 
287 aa  184  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  40.43 
 
 
236 aa  184  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  41.23 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  37.45 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.15 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  42.54 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  38.65 
 
 
580 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  39.19 
 
 
309 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.56 
 
 
305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.94 
 
 
316 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  36.21 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
317 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.64 
 
 
317 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  38.46 
 
 
261 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 
305 aa  182  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  39.33 
 
 
237 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.96 
 
 
339 aa  183  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  39.57 
 
 
312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 
312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  39.57 
 
 
312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  37.55 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.41 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  39.34 
 
 
590 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>