More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0740 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  496  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  70.85 
 
 		 246 aa  361  7.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  66.8 
 
 		 250 aa  338  4e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  66.8 
 
 		 250 aa  338  4e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  62.8 
 
 		 249 aa  323  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  46.5 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  51.24 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  48.32 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  44.53 
 
 		 257 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  44.77 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 		 241 aa  222  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  45.64 
 
 		 241 aa  221  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  45.64 
 
 		 241 aa  221  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  44.77 
 
 		 259 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  41.74 
 
 		 245 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  45.64 
 
 		 241 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  46.03 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 		 241 aa  215  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  43.98 
 
 		 241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  44.63 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 253 aa  211  5.999999999999999e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  43.7 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  44.35 
 
 		 237 aa  202  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  40 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  45.42 
 
 		 256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  42.6 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  42.67 
 
 		 313 aa  195  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  40.16 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  39.75 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 272 aa  195  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  40.93 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  38.68 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  40.59 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  43.05 
 
 		 236 aa  191  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  42.22 
 
 		 313 aa  191  8e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 247 aa  191  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  36.59 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1004  ABC transporter related  41.1 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00470286 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.39 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  40 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  40.59 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.86 
 
 		 312 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  39.91 
 
 		 314 aa  188  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  39.73 
 
 		 337 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.27 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  38.49 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 541 aa  187  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  42.61 
 
 		 327 aa  186  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  40.26 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  43.58 
 
 		 308 aa  185  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  39.67 
 
 		 252 aa  184  8e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.87 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  38.75 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  42.59 
 
 		 312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  42.59 
 
 		 312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.01 
 
 		 316 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 312 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 312 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 		 249 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 		 318 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  44.14 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  41.07 
 
 		 327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  39.83 
 
 		 312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  38.24 
 
 		 238 aa  182  6e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 312 aa  181  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  39.3 
 
 		 287 aa  181  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  36.29 
 
 		 303 aa  181  8.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  39.75 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 		 312 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  37.6 
 
 		 414 aa  181  9.000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1289  ABC transporter related  36.67 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.077287  hitchhiker  0.00948798 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.94 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  42.38 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  39.91 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  40.25 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  39.37 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.55 
 
 		 305 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 309 aa  178  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 318 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  43.12 
 
 		 308 aa  178  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>