More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3072 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  100 
 
 		 254 aa  498  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  61.6 
 
 		 272 aa  305  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.25 
 
 		 295 aa  301  8.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  59.27 
 
 		 268 aa  289  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  59.52 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  59.29 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.63 
 
 		 256 aa  277  9e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2589  ATP-binding transport protein NatA  61.13 
 
 		 266 aa  275  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.408024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  55.74 
 
 		 279 aa  275  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2751  ABC transporter related  58.37 
 
 		 249 aa  275  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  55.87 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.73 
 
 		 274 aa  268  8e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.905308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  59.32 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  53.06 
 
 		 306 aa  261  4.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  57.54 
 
 		 257 aa  261  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3107  ABC transporter related  61.04 
 
 		 297 aa  259  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000121464  hitchhiker  0.00525293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.95 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  51.79 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  48.99 
 
 		 301 aa  248  6e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 		 255 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  46.19 
 
 		 253 aa  214  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.26 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  36.21 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  41.51 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  33.91 
 
 		 259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  29.92 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  34.98 
 
 		 328 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1004  ABC transporter related  34.78 
 
 		 237 aa  162  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00470286 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  38.64 
 
 		 337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  33.48 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  34.44 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  39.23 
 
 		 310 aa  161  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  35.51 
 
 		 251 aa  162  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.44 
 
 		 312 aa  160  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.27 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  35.4 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2857  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00741343  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  37.38 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  40.38 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  36.33 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  35.12 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  37.84 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  37.39 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  36.77 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  35.54 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.7 
 
 		 317 aa  157  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.38 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1367  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  36.48 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0150774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  33.76 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  33.64 
 
 		 312 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  33.64 
 
 		 312 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  35.45 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  38.01 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  30.47 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  35.86 
 
 		 414 aa  156  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  35.19 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 312 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  36.67 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  37.89 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 312 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 312 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 312 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  40.2 
 
 		 292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  33.18 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  37.29 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  35.9 
 
 		 318 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  37.35 
 
 		 249 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  31.56 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.07 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3430  ABC transporter-like protein  38.66 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  37.74 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2058  ABC transporter, ATPase subunit  34.31 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.27 
 
 		 342 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  36.36 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  32.73 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  37 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  32.77 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  35.78 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  39.81 
 
 		 318 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  37.44 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  37.44 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.96 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  34.74 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  32.56 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  31.93 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  36.86 
 
 		 247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  35.78 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  35.65 
 
 		 315 aa  152  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  38.4 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 304 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  35.78 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>