More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0878 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 266 aa  528  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  59.45 
 
 		 258 aa  320  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  51.21 
 
 		 256 aa  273  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  40 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  37.65 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  39.52 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  37.77 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  43.94 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  32.8 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  36.86 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.81 
 
 		 309 aa  175  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  37.44 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 244 aa  175  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  36.18 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  37.05 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  44.39 
 
 		 288 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  37.44 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 241 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  36.32 
 
 		 241 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  39.7 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  32.58 
 
 		 334 aa  168  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  34.45 
 
 		 243 aa  168  9e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  33.19 
 
 		 245 aa  168  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.9 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  32.79 
 
 		 309 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.07 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  38.6 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  32.78 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  39.37 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  33.99 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  36.29 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  37.13 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  34.8 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  35.98 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  35.98 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  35.04 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.04 
 
 		 338 aa  165  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  34.8 
 
 		 249 aa  164  9e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  35.45 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  38.1 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  35.42 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  31.09 
 
 		 303 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  35.29 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  34.19 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  35.09 
 
 		 242 aa  163  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  37.56 
 
 		 238 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  34.32 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.23 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  34.19 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  34.56 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  32.13 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1924  ABC transporter related  34.98 
 
 		 246 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1890  ABC transporter related  34.98 
 
 		 246 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.670859  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 305 aa  161  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 		 301 aa  161  9e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  36.32 
 
 		 299 aa  160  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  31.91 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1566  ABC transporter related  36.17 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 369 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  35 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  34.53 
 
 		 306 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  35.04 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  33.33 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.67 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  35.45 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  35.17 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  35.29 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1372  ABC transporter, ATP-binding protein  34.73 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00133001  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.53 
 
 		 318 aa  159  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  33.19 
 
 		 328 aa  159  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  39.9 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  35.56 
 
 		 239 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.44 
 
 		 243 aa  160  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  34.06 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  35.78 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  32.02 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  35.48 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.02 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 315 aa  159  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  32.47 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  33.48 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.2 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  38.07 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>