More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1806 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1806  ABC transporter related  100 
 
 
294 aa  585  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.802258  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1793  ABC transporter-like protein  61.89 
 
 
270 aa  295  6e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1439  ABC transporter related protein  60.08 
 
 
299 aa  295  6e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1953  ABC transporter related protein  59.7 
 
 
272 aa  289  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00018631  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2474  ABC transporter related  62.23 
 
 
299 aa  276  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.471366  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2353  ABC transporter related  56.25 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.341379  normal  0.122242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3594  ABC transporter related  61.02 
 
 
299 aa  265  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0405  ABC transporter related  52.1 
 
 
270 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000127711  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.41 
 
 
334 aa  187  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  45.37 
 
 
334 aa  186  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.3 
 
 
321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  40.16 
 
 
257 aa  182  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  41.53 
 
 
303 aa  182  7e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.5 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  39.46 
 
 
330 aa  178  8e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2251  ABC transporter related protein  42.98 
 
 
266 aa  178  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00759154  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  46.23 
 
 
285 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  38.56 
 
 
251 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  44.78 
 
 
249 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.08 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.04 
 
 
330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.68 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.08 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  43.69 
 
 
345 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  42.62 
 
 
253 aa  172  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  38.63 
 
 
253 aa  171  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.78 
 
 
353 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  41.77 
 
 
291 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  39.6 
 
 
259 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  41.57 
 
 
248 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.06 
 
 
331 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.89 
 
 
325 aa  169  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  40 
 
 
257 aa  168  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.87 
 
 
331 aa  168  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.25 
 
 
337 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.19 
 
 
324 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 
316 aa  168  1e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.17 
 
 
317 aa  167  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  37.24 
 
 
243 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  42.72 
 
 
314 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5653  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.09 
 
 
255 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.26 
 
 
374 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.99 
 
 
325 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.74 
 
 
446 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.12 
 
 
327 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.67 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  40.83 
 
 
314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  38.52 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1188  ABC transporter related protein  40.53 
 
 
262 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  unclonable  0.00000880668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
326 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
307 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  37.16 
 
 
260 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4937  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.68 
 
 
347 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691547  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  40.17 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  36.4 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  40.16 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0392  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.52 
 
 
347 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.64 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.67 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  40.79 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.5 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.13 
 
 
308 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.56 
 
 
345 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.41 
 
 
334 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.49 
 
 
320 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.38 
 
 
332 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.88 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 
578 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 
325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.83 
 
 
339 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.4 
 
 
578 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  36.4 
 
 
578 aa  162  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  36.4 
 
 
578 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
578 aa  162  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
578 aa  162  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  36.4 
 
 
578 aa  162  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
578 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
578 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.99 
 
 
305 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  36.44 
 
 
241 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  34.04 
 
 
580 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  34.04 
 
 
580 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  36.93 
 
 
582 aa  162  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.09 
 
 
333 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 
308 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.93 
 
 
305 aa  161  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.29 
 
 
328 aa  161  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  40.5 
 
 
311 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.95 
 
 
324 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4655  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.36 
 
 
449 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  40.87 
 
 
240 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.4 
 
 
323 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  40.5 
 
 
317 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  35.5 
 
 
250 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  42.34 
 
 
323 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>