More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2699 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  100 
 
 		 310 aa  620  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  86.77 
 
 		 310 aa  543  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  55.7 
 
 		 302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  54.75 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  52.15 
 
 		 305 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  43.23 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  46.67 
 
 		 305 aa  258  8e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  44.12 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1807  ABC transporter related  42.3 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  45.15 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  42.02 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 309 aa  202  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  40.86 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  37.91 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  38.24 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  37.38 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  47.71 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  39.94 
 
 		 302 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  43.83 
 
 		 310 aa  195  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  45.85 
 
 		 318 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  45.85 
 
 		 318 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  39.87 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  38.82 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  36.22 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  39.69 
 
 		 367 aa  192  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  35.95 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  34.97 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 		 303 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  48.58 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  38.74 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  38.56 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  43.72 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3286  ABC transporter-like  39.43 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.74 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  38.94 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  44.29 
 
 		 327 aa  185  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  44.28 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  43.33 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  45.28 
 
 		 313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  37.78 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  36.66 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  43.35 
 
 		 247 aa  182  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.98 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  44.81 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  36.72 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  32.52 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  39.13 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  38.94 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  39.4 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  38.03 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  35.18 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  41.86 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  37.22 
 
 		 308 aa  176  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  41.13 
 
 		 275 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  36.89 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  44.28 
 
 		 247 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.2 
 
 		 317 aa  175  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 369 aa  175  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  45.41 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  32.58 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  45.12 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  31.78 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  39.2 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  32.58 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  32.58 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  40.25 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  35.81 
 
 		 350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  38.64 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  33.55 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.08 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  45.93 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  40 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  43.05 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  32.05 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  32.14 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  37.91 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  41.28 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1062  ABC transporter-like protein protein  42.86 
 
 		 326 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.124744  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  33.22 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  34.06 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  44.02 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  45.5 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  36.6 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  39.54 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  41.4 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  36.74 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  45.02 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  37.67 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  35.88 
 
 		 332 aa  169  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>