More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2447 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  100 
 
 
305 aa  619  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  58.45 
 
 
299 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  43.19 
 
 
314 aa  248  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  45.67 
 
 
311 aa  247  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  43.04 
 
 
323 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  44.3 
 
 
311 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  42.58 
 
 
315 aa  238  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  41.97 
 
 
312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  42.95 
 
 
315 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  50.64 
 
 
317 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  40.6 
 
 
314 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  40.33 
 
 
319 aa  228  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  43.37 
 
 
305 aa  228  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  41.47 
 
 
328 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  41.12 
 
 
319 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  39.61 
 
 
315 aa  226  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  38.59 
 
 
325 aa  225  9e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  39.47 
 
 
320 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  41.5 
 
 
315 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  41.12 
 
 
319 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  40.97 
 
 
583 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  42.26 
 
 
315 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  40.4 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  40.94 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  42.42 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  38.82 
 
 
324 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  41.78 
 
 
576 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  38.89 
 
 
667 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  42.14 
 
 
307 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  39.6 
 
 
309 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  40.46 
 
 
314 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  38.13 
 
 
322 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  38.05 
 
 
316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  41.5 
 
 
317 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  40.41 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  49.77 
 
 
510 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  40.07 
 
 
310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  39.19 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  40 
 
 
582 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  39.23 
 
 
579 aa  212  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  42.07 
 
 
580 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  41.89 
 
 
312 aa  212  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  42.07 
 
 
580 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  45.92 
 
 
512 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  39.46 
 
 
318 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3112  ABC transporter, ATPase subunit  40.55 
 
 
310 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  39.25 
 
 
323 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  40.53 
 
 
313 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  41.04 
 
 
317 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.5 
 
 
322 aa  209  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  43.67 
 
 
248 aa  208  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  41.29 
 
 
312 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  39.53 
 
 
346 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  39.53 
 
 
346 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  45.45 
 
 
301 aa  207  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  38.93 
 
 
346 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  49.33 
 
 
311 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  38.13 
 
 
323 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  38.38 
 
 
318 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1081  ATPase  40.86 
 
 
310 aa  206  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  38.38 
 
 
318 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  38.38 
 
 
318 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 
309 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  38.46 
 
 
314 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  38.38 
 
 
318 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  38.05 
 
 
335 aa  206  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  40.39 
 
 
589 aa  206  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  38.91 
 
 
578 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  38.91 
 
 
578 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.98 
 
 
311 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  36.91 
 
 
340 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  39.79 
 
 
580 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
578 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  42.75 
 
 
590 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  40.07 
 
 
587 aa  204  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 
308 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
578 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 
578 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  37.34 
 
 
333 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
578 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  38.91 
 
 
578 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
578 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
578 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 
578 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  42.99 
 
 
270 aa  204  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  37.92 
 
 
317 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
578 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 
578 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2917  ABC transporter related  41.52 
 
 
307 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 
578 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  49.29 
 
 
314 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 
578 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  45.22 
 
 
594 aa  203  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  39.33 
 
 
302 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  36.72 
 
 
307 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  38.41 
 
 
585 aa  201  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 
350 aa  201  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  39.21 
 
 
583 aa  201  9e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  37.75 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  44.78 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>