More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1044 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  100 
 
 		 331 aa  643    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4353  ABC transporter related  49.25 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0121046  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  48.09 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  46.25 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  42.21 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  42.76 
 
 		 301 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  48.17 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  39.67 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  41.69 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.65 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  37.91 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  40.98 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  35.43 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  39.34 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.89 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  36.36 
 
 		 316 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  41.21 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  36.04 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  35.6 
 
 		 306 aa  182  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 321 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  39.31 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  45.21 
 
 		 582 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  36.54 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  39.47 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  38.36 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  36.01 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  38.51 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  37.5 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  43.38 
 
 		 579 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  42.01 
 
 		 576 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  43.89 
 
 		 287 aa  179  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2055  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.83 
 
 		 318 aa  179  7e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.280833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  39.25 
 
 		 290 aa  179  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  32.89 
 
 		 288 aa  178  9e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.91 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  45.66 
 
 		 576 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  41.54 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.42 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  40.99 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  44.8 
 
 		 512 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  36.79 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.38 
 
 		 578 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  43.38 
 
 		 578 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 578 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  41.55 
 
 		 580 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 		 580 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  43.38 
 
 		 578 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 578 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 578 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 578 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 		 578 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  43.38 
 
 		 578 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.9 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  40.16 
 
 		 282 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 578 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.48 
 
 		 329 aa  176  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 578 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.58 
 
 		 308 aa  176  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 578 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 578 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 		 578 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  41.89 
 
 		 256 aa  175  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  37.75 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  43.44 
 
 		 585 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0177  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.42 
 
 		 329 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0504097 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2704  ABC transporter related  38.91 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  35.6 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  47.83 
 
 		 283 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  36.54 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.75 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  37.94 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  45.41 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  35.69 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  41.36 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.09 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  44.58 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.24 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  35.74 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  43.24 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  41.89 
 
 		 580 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 585 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  42.6 
 
 		 581 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  40.58 
 
 		 308 aa  173  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  39.76 
 
 		 326 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  37.33 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  41.85 
 
 		 582 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 		 356 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  41.3 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  43.5 
 
 		 510 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.84 
 
 		 321 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  38.79 
 
 		 315 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>