More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4957 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  69.44 
 
 
253 aa  359  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  65.29 
 
 
310 aa  332  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  65.4 
 
 
267 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.26 
 
 
336 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  61.79 
 
 
258 aa  322  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  63.03 
 
 
316 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  62.92 
 
 
314 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  61.79 
 
 
258 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  63.4 
 
 
333 aa  322  4e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  62.81 
 
 
317 aa  321  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  62.98 
 
 
332 aa  321  9.000000000000001e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  63.4 
 
 
317 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  60.41 
 
 
261 aa  319  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  62.04 
 
 
270 aa  318  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  62.55 
 
 
279 aa  318  5e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  58.43 
 
 
263 aa  318  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  62.55 
 
 
254 aa  318  6e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  62.55 
 
 
277 aa  318  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  61.86 
 
 
264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  61.6 
 
 
288 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  63.4 
 
 
283 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  62.55 
 
 
282 aa  308  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  61.6 
 
 
258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.9 
 
 
268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  60.91 
 
 
271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  60.82 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  62.55 
 
 
289 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  62.98 
 
 
282 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  60.26 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  57.26 
 
 
252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  61.86 
 
 
262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  61.7 
 
 
289 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  58.33 
 
 
244 aa  300  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  58.87 
 
 
321 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  58.4 
 
 
311 aa  299  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  59.34 
 
 
247 aa  299  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  61.18 
 
 
267 aa  298  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  56.43 
 
 
253 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  55.2 
 
 
253 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  55.2 
 
 
253 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  58.27 
 
 
264 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  61.54 
 
 
263 aa  295  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  59.15 
 
 
240 aa  295  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  57.72 
 
 
262 aa  293  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  58.47 
 
 
243 aa  293  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  57.72 
 
 
262 aa  293  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  54.55 
 
 
254 aa  292  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 
246 aa  291  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  58.3 
 
 
258 aa  291  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 
262 aa  291  9e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  59.91 
 
 
268 aa  290  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  55.69 
 
 
249 aa  290  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 
241 aa  290  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  59.05 
 
 
241 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  59.05 
 
 
241 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  60.17 
 
 
256 aa  289  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  57.89 
 
 
258 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  57.89 
 
 
258 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  57.89 
 
 
258 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  57.89 
 
 
258 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  57.89 
 
 
258 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  57.14 
 
 
263 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  57.89 
 
 
258 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  57.89 
 
 
258 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  55.73 
 
 
265 aa  288  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  59.75 
 
 
268 aa  288  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  56.71 
 
 
241 aa  288  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  58.3 
 
 
268 aa  288  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  57.55 
 
 
261 aa  288  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  57.08 
 
 
240 aa  287  9e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  58.3 
 
 
244 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  56.71 
 
 
241 aa  286  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  56.71 
 
 
244 aa  286  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  57.14 
 
 
258 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.71 
 
 
241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  59.31 
 
 
243 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  59.31 
 
 
243 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  56.73 
 
 
261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  58.47 
 
 
239 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  59.31 
 
 
243 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  56.78 
 
 
244 aa  285  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  58.87 
 
 
243 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  58.87 
 
 
243 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  58.87 
 
 
243 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  58.87 
 
 
243 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  56.73 
 
 
258 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  56.73 
 
 
258 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  56.36 
 
 
244 aa  285  7e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  58.47 
 
 
239 aa  285  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  57.14 
 
 
241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  55.84 
 
 
241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  56.28 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  58.87 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  55.87 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  56.28 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  61.54 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  56.71 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  56.71 
 
 
241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  61.54 
 
 
250 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>