More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3585 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  77.33 
 
 		 249 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  77.82 
 
 		 253 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  77.82 
 
 		 253 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  76.31 
 
 		 252 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  77.55 
 
 		 253 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  76.15 
 
 		 244 aa  363  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  67.07 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  61.72 
 
 		 263 aa  322  5e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  66.39 
 
 		 264 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  65.97 
 
 		 288 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  64.98 
 
 		 311 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  60.56 
 
 		 310 aa  311  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  63.64 
 
 		 282 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  64.98 
 
 		 321 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  63.79 
 
 		 268 aa  310  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  60.08 
 
 		 258 aa  309  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  60.08 
 
 		 258 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  62.81 
 
 		 289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  63.45 
 
 		 271 aa  308  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  62.14 
 
 		 289 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  60.24 
 
 		 290 aa  307  9e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  60.64 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  64.56 
 
 		 261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  62.45 
 
 		 279 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  61.54 
 
 		 270 aa  304  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  62.03 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  62.03 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  62.5 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  60.16 
 
 		 283 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  59.07 
 
 		 264 aa  300  1e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  59.58 
 
 		 241 aa  299  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  62.92 
 
 		 333 aa  299  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  62.03 
 
 		 316 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  59.17 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  61.34 
 
 		 267 aa  296  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  62.03 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.67 
 
 		 336 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  61.18 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  61.67 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  54.55 
 
 		 256 aa  292  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  60.76 
 
 		 314 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  56.96 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  56.25 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  57.14 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  58.37 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  56.59 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  55.95 
 
 		 253 aa  288  7e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  58.23 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  56.54 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  57.09 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  55.81 
 
 		 261 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  58.23 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  57.09 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  57.81 
 
 		 268 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.56 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  56.69 
 
 		 258 aa  284  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  57.2 
 
 		 264 aa  284  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  56.15 
 
 		 260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  55.91 
 
 		 258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  57.56 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  56.65 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  55.91 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  57.38 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  55.7 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  55.91 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  55.91 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  55.91 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  55.91 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  55.91 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  56.3 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  56.3 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  55.91 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  56.3 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.67 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  56.3 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  54.43 
 
 		 246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 		 249 aa  281  7.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  56.3 
 
 		 249 aa  281  7.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  57.81 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2417  ABC transporter related  60.5 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204694 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  58.4 
 
 		 241 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  57.98 
 
 		 241 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  54.43 
 
 		 246 aa  279  4e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  57.14 
 
 		 243 aa  279  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  56.61 
 
 		 262 aa  278  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  57.61 
 
 		 264 aa  278  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  54.85 
 
 		 244 aa  278  5e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  54.01 
 
 		 244 aa  278  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  56.72 
 
 		 241 aa  278  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  57.14 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  57.43 
 
 		 262 aa  278  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  57.98 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  57.98 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  56.72 
 
 		 241 aa  275  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  58.65 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>