More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3178 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 241 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  74.27 
 
 		 241 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  73.86 
 
 		 241 aa  371  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  74.27 
 
 		 241 aa  370  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  74.27 
 
 		 241 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  74.69 
 
 		 241 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  74.27 
 
 		 241 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  74.27 
 
 		 241 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  74.27 
 
 		 241 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  73.03 
 
 		 241 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  73.44 
 
 		 241 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  72.2 
 
 		 241 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  70.12 
 
 		 241 aa  358  6e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  69.71 
 
 		 241 aa  355  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  69.71 
 
 		 241 aa  353  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  71.67 
 
 		 246 aa  350  8e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  69.29 
 
 		 241 aa  350  8e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  69.29 
 
 		 241 aa  349  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  69.71 
 
 		 259 aa  348  5e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2714  ABC transporter related  71.78 
 
 		 241 aa  345  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  68.49 
 
 		 243 aa  344  8e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  67.22 
 
 		 241 aa  343  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  68.05 
 
 		 241 aa  342  2.9999999999999997e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2417  ABC transporter related  70.54 
 
 		 241 aa  336  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204694 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  68.05 
 
 		 241 aa  335  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  68.05 
 
 		 241 aa  335  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  67.22 
 
 		 265 aa  334  7e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  69.75 
 
 		 243 aa  333  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  69.75 
 
 		 243 aa  333  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  69.75 
 
 		 243 aa  333  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  66.39 
 
 		 241 aa  333  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  69.75 
 
 		 243 aa  332  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  66.39 
 
 		 265 aa  332  3e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  64.73 
 
 		 241 aa  332  4e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  70.17 
 
 		 243 aa  331  5e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  68.91 
 
 		 243 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  69.33 
 
 		 243 aa  330  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  68.91 
 
 		 243 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  68.91 
 
 		 243 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  68.91 
 
 		 243 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  69.75 
 
 		 243 aa  330  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  68.91 
 
 		 243 aa  329  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  69.33 
 
 		 243 aa  328  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  69.46 
 
 		 243 aa  328  7e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  63.9 
 
 		 241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  68.22 
 
 		 271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  65.98 
 
 		 241 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.9 
 
 		 241 aa  324  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.9 
 
 		 241 aa  323  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  320  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.07 
 
 		 241 aa  320  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  68.07 
 
 		 243 aa  318  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  65.42 
 
 		 247 aa  319  3e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1152  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  65.56 
 
 		 241 aa  316  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  62.66 
 
 		 241 aa  316  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0442  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  65.56 
 
 		 241 aa  316  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0506  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  65.56 
 
 		 241 aa  316  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.503338  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  62.66 
 
 		 249 aa  315  3e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  62.66 
 
 		 249 aa  315  3e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.83 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.83 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.24 
 
 		 241 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  62.24 
 
 		 241 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  62.24 
 
 		 241 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.24 
 
 		 241 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  62.24 
 
 		 241 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.24 
 
 		 241 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  61.83 
 
 		 240 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.24 
 
 		 241 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.24 
 
 		 241 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.24 
 
 		 241 aa  311  5.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  60.66 
 
 		 263 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  62.7 
 
 		 268 aa  303  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  60.25 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  57.98 
 
 		 310 aa  300  9e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  60.91 
 
 		 262 aa  300  9e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  59.84 
 
 		 256 aa  300  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  61.51 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  61.76 
 
 		 270 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  61.48 
 
 		 268 aa  299  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  62.96 
 
 		 244 aa  299  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  60.5 
 
 		 239 aa  297  8e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  60.91 
 
 		 265 aa  297  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  59.5 
 
 		 264 aa  295  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  60.25 
 
 		 240 aa  294  8e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  59.66 
 
 		 258 aa  293  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  61.48 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  57.98 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  59.24 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  62.66 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  56.72 
 
 		 258 aa  292  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  59.66 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  59.24 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  58.4 
 
 		 279 aa  290  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  58.4 
 
 		 277 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>