More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3684 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  100 
 
 
244 aa  494  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  75.82 
 
 
246 aa  384  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  76.64 
 
 
245 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  74.59 
 
 
247 aa  370  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  72.95 
 
 
246 aa  371  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  73.33 
 
 
254 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  72.13 
 
 
251 aa  363  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  71.49 
 
 
243 aa  358  6e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  71.9 
 
 
243 aa  358  6e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  70.25 
 
 
243 aa  353  2e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  64.02 
 
 
249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  62.08 
 
 
244 aa  310  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  61.92 
 
 
244 aa  305  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  60.67 
 
 
244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  60.67 
 
 
244 aa  302  4.0000000000000003e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 
241 aa  301  9e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  60.25 
 
 
244 aa  300  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  60.67 
 
 
244 aa  300  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  60.25 
 
 
241 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  60.5 
 
 
311 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  60.25 
 
 
244 aa  299  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  60.25 
 
 
241 aa  299  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  60.5 
 
 
241 aa  297  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  62.18 
 
 
241 aa  297  8e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 
241 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  58.33 
 
 
243 aa  296  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  59.24 
 
 
241 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1638  ABC transporter-like  62.13 
 
 
242 aa  293  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0878817  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 
241 aa  293  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  59.24 
 
 
241 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  59.24 
 
 
241 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  59.49 
 
 
288 aa  292  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  59.24 
 
 
241 aa  291  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  58.82 
 
 
241 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  58.58 
 
 
241 aa  291  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  57.56 
 
 
321 aa  291  8e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0513  ATPase  57.92 
 
 
250 aa  291  8e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.911954  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  57.38 
 
 
247 aa  291  8e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  60 
 
 
253 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  58.4 
 
 
241 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  57.98 
 
 
241 aa  289  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4389  ABC transporter-like protein protein  62.13 
 
 
242 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  58.3 
 
 
249 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  58.58 
 
 
239 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  60.67 
 
 
239 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  58.3 
 
 
252 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  58.82 
 
 
277 aa  288  4e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  60.5 
 
 
242 aa  289  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  58.4 
 
 
241 aa  288  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  60.34 
 
 
263 aa  288  8e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  58.58 
 
 
241 aa  287  9e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  59.24 
 
 
289 aa  287  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  60.25 
 
 
241 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  60.25 
 
 
241 aa  286  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  59.13 
 
 
253 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  59.13 
 
 
253 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  58.23 
 
 
254 aa  286  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  57.98 
 
 
242 aa  286  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  58.33 
 
 
243 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  58.33 
 
 
243 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  58.33 
 
 
243 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  58.47 
 
 
265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.56 
 
 
241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  58.82 
 
 
289 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  58.82 
 
 
290 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  57.81 
 
 
245 aa  285  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  58.33 
 
 
243 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  58.33 
 
 
243 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  58.33 
 
 
243 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  58.33 
 
 
243 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  58.75 
 
 
243 aa  285  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  57.98 
 
 
241 aa  285  5e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  58.47 
 
 
265 aa  285  5.999999999999999e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  59.58 
 
 
241 aa  284  7e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 
243 aa  284  7e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  58.4 
 
 
241 aa  284  8e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  59.07 
 
 
310 aa  284  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  59.66 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  60.33 
 
 
266 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4299  ABC transporter-related protein  56.2 
 
 
255 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  57.38 
 
 
268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.14 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  57.98 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  56.6 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  56.12 
 
 
241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  57.56 
 
 
259 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  60.59 
 
 
263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  57.14 
 
 
241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 
246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  59.49 
 
 
245 aa  282  4.0000000000000003e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  58.33 
 
 
243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.72 
 
 
241 aa  281  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  58.82 
 
 
283 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  58.23 
 
 
261 aa  281  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  58.75 
 
 
262 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  58.75 
 
 
262 aa  281  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  58.75 
 
 
262 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  58.65 
 
 
244 aa  281  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  57.81 
 
 
264 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  60.08 
 
 
243 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>