More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0595 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  100 
 
 		 249 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  67.92 
 
 		 244 aa  342  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  66.12 
 
 		 244 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  66.11 
 
 		 243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  66.25 
 
 		 244 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  65.69 
 
 		 243 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  64.58 
 
 		 244 aa  333  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  62.96 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  63.37 
 
 		 244 aa  328  4e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  65.42 
 
 		 243 aa  328  7e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  64.02 
 
 		 244 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  62.4 
 
 		 244 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  63.18 
 
 		 245 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  62.25 
 
 		 251 aa  318  5e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  62.08 
 
 		 254 aa  317  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  60.74 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  59.5 
 
 		 246 aa  312  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  58.68 
 
 		 246 aa  311  7.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  62.92 
 
 		 242 aa  309  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  59.92 
 
 		 246 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  61.21 
 
 		 271 aa  293  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  58.51 
 
 		 242 aa  292  4e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  60.66 
 
 		 311 aa  291  9e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  59.07 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  58.5 
 
 		 268 aa  289  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  60.76 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  57.89 
 
 		 247 aa  288  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  56.97 
 
 		 265 aa  289  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  61 
 
 		 310 aa  288  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  59.5 
 
 		 316 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.65 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  56.49 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0513  ATPase  60.73 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.911954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  56.17 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  57.44 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  60.34 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  60.34 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  61.3 
 
 		 267 aa  285  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  62.87 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  59.83 
 
 		 256 aa  285  4e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  62.87 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1638  ABC transporter-like  60.34 
 
 		 242 aa  285  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0878817  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  57.38 
 
 		 240 aa  285  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  59.09 
 
 		 263 aa  284  8e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  59.91 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  58.23 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  56.72 
 
 		 252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  58.68 
 
 		 261 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  57.14 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  58.23 
 
 		 279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  57.14 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  57.09 
 
 		 262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  58.23 
 
 		 277 aa  282  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4299  ABC transporter-related protein  60.58 
 
 		 255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.76 
 
 		 336 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  58.68 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  57.55 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4313  ABC transporter related  60.92 
 
 		 251 aa  281  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  59.92 
 
 		 270 aa  281  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  57.44 
 
 		 246 aa  281  9e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  57.5 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  56.54 
 
 		 241 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1517  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 260 aa  280  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  58.05 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  61.8 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  59.49 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  56.43 
 
 		 253 aa  279  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  59.49 
 
 		 317 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0679  ABC transporter related  55.7 
 
 		 248 aa  278  4e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  60.76 
 
 		 283 aa  278  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  57.87 
 
 		 253 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  55.65 
 
 		 240 aa  278  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  57.87 
 
 		 253 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4389  ABC transporter-like protein protein  59.32 
 
 		 242 aa  278  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  59.49 
 
 		 332 aa  278  8e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  58.23 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  57.98 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  56.3 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3751  ABC transporter related  55.7 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619335 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  58.44 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  55.88 
 
 		 243 aa  275  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  55.04 
 
 		 241 aa  276  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  56.63 
 
 		 264 aa  275  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  60 
 
 		 317 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1236  ABC transporter related protein  55.1 
 
 		 245 aa  275  5e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.839262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  60 
 
 		 314 aa  274  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  56.28 
 
 		 255 aa  274  8e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  59.92 
 
 		 290 aa  274  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  53.78 
 
 		 242 aa  274  9e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  60.34 
 
 		 282 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  55.04 
 
 		 241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  59.92 
 
 		 289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  59.49 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.56 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  59.24 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.56 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  55.42 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.56 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>