More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0673 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  100 
 
 		 262 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  92.18 
 
 		 263 aa  450  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  88.98 
 
 		 256 aa  431  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  81.64 
 
 		 265 aa  417  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  88.1 
 
 		 255 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  84.9 
 
 		 268 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  81.23 
 
 		 264 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  83.27 
 
 		 264 aa  411  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  89.39 
 
 		 250 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  77.96 
 
 		 251 aa  384  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  73.15 
 
 		 268 aa  377  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  72.94 
 
 		 258 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  70.99 
 
 		 261 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  70.61 
 
 		 261 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  72.55 
 
 		 258 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  71.37 
 
 		 258 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  72.55 
 
 		 258 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  72.55 
 
 		 258 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  72.55 
 
 		 258 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  72.55 
 
 		 258 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  71.37 
 
 		 258 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  72.55 
 
 		 258 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  71.37 
 
 		 258 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  72.55 
 
 		 258 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  71.6 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  71.37 
 
 		 258 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  71.04 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  68.44 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  71.6 
 
 		 263 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  68.44 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  70.98 
 
 		 258 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  71.49 
 
 		 258 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  70.5 
 
 		 266 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  72.24 
 
 		 258 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  69.05 
 
 		 255 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  67.73 
 
 		 255 aa  349  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  66.92 
 
 		 268 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  68.57 
 
 		 244 aa  339  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  62.96 
 
 		 241 aa  319  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  61.73 
 
 		 241 aa  317  9e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  62.14 
 
 		 241 aa  315  5e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  62.45 
 
 		 240 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  63.79 
 
 		 247 aa  314  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  62.04 
 
 		 240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  68.98 
 
 		 240 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  63.93 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  63.93 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  63.93 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  63.52 
 
 		 243 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  63.52 
 
 		 243 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  63.52 
 
 		 243 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  63.52 
 
 		 243 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  60.66 
 
 		 243 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  63.52 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  61.69 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  64.34 
 
 		 243 aa  305  6e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  60.49 
 
 		 249 aa  305  7e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  60.49 
 
 		 249 aa  305  7e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  60.32 
 
 		 241 aa  304  8.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  62.3 
 
 		 243 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  60.85 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  61.86 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  61.13 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  59.18 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.59 
 
 		 241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.59 
 
 		 241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.59 
 
 		 241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  62.7 
 
 		 243 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.59 
 
 		 241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  60.91 
 
 		 241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.59 
 
 		 241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  60.91 
 
 		 241 aa  301  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  60 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.18 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  62.04 
 
 		 239 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  61.51 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  59.85 
 
 		 289 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  59.51 
 
 		 241 aa  299  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  60.16 
 
 		 316 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  59.51 
 
 		 241 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  60 
 
 		 241 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  59.59 
 
 		 241 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  59.59 
 
 		 241 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  60 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  59.18 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  60 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  61.63 
 
 		 243 aa  298  7e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  62.3 
 
 		 311 aa  298  8e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  62.04 
 
 		 243 aa  298  9e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  58.78 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  59.14 
 
 		 317 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  60.15 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  59.84 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  59.18 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  60.41 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  59.07 
 
 		 290 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  57.55 
 
 		 241 aa  296  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  59.02 
 
 		 258 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  58.62 
 
 		 283 aa  295  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>