More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2605 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  80.58 
 
 		 253 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  80.83 
 
 		 253 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  80.83 
 
 		 253 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  74.06 
 
 		 249 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  74.07 
 
 		 252 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  76.15 
 
 		 254 aa  363  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  67.36 
 
 		 258 aa  332  5e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  65.42 
 
 		 264 aa  325  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  66.39 
 
 		 288 aa  321  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  64.85 
 
 		 271 aa  320  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  65.55 
 
 		 263 aa  319  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  63.95 
 
 		 310 aa  311  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  63.29 
 
 		 270 aa  308  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  61.73 
 
 		 267 aa  306  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  63.14 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  62.61 
 
 		 267 aa  306  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  63.36 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  62.92 
 
 		 279 aa  301  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 		 277 aa  301  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 		 254 aa  301  5.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.87 
 
 		 336 aa  301  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  62.87 
 
 		 283 aa  300  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  63.71 
 
 		 282 aa  300  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  58.33 
 
 		 256 aa  300  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  61.07 
 
 		 333 aa  300  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  62.03 
 
 		 316 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  62.87 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  62.13 
 
 		 321 aa  298  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  61.07 
 
 		 332 aa  298  5e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  60.49 
 
 		 258 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  61.67 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  60.49 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  61.18 
 
 		 317 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  60.76 
 
 		 314 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.52 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  61.18 
 
 		 290 aa  292  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  61.18 
 
 		 289 aa  292  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  61.13 
 
 		 264 aa  292  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  60.76 
 
 		 317 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  56.72 
 
 		 241 aa  291  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  60.76 
 
 		 289 aa  291  9e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  57.98 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  57.38 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.8 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  56.72 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  57.2 
 
 		 240 aa  287  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  60.34 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  57.44 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  56.3 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  56.54 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 264 aa  285  5e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  59.49 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  56.6 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  57.98 
 
 		 243 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  54.17 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  57.39 
 
 		 254 aa  281  9e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  56.3 
 
 		 242 aa  281  9e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  57.14 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  57.55 
 
 		 261 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  57.55 
 
 		 258 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  56.72 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  54.85 
 
 		 244 aa  279  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  57.55 
 
 		 258 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  57.89 
 
 		 258 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  57.55 
 
 		 258 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  57.14 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  58.16 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  56.3 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 		 262 aa  278  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 		 241 aa  278  4e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  57.85 
 
 		 262 aa  278  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  57.85 
 
 		 262 aa  278  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  57.96 
 
 		 258 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  58.3 
 
 		 263 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  56.73 
 
 		 261 aa  277  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  59.26 
 
 		 265 aa  277  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  55.98 
 
 		 246 aa  276  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  57.55 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.72 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  56.3 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  54.62 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  57.89 
 
 		 266 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  59.26 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  57.55 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  61.32 
 
 		 268 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  55.88 
 
 		 241 aa  275  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 258 aa  275  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  56.3 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>