More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0356 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  100 
 
 
266 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  92.48 
 
 
263 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  86.21 
 
 
262 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  89.47 
 
 
262 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  86.21 
 
 
262 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  81.63 
 
 
255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  82.52 
 
 
261 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  80 
 
 
255 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  82.11 
 
 
260 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  81.3 
 
 
258 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  82.11 
 
 
261 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  80.49 
 
 
258 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  80.49 
 
 
258 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  80.49 
 
 
258 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  80.49 
 
 
258 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  80.49 
 
 
258 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  81.05 
 
 
258 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  80.49 
 
 
258 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  81.3 
 
 
258 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  80.49 
 
 
258 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  80.49 
 
 
258 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  80.49 
 
 
258 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  80.08 
 
 
258 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  80.08 
 
 
258 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  80.08 
 
 
258 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  72.06 
 
 
262 aa  363  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  73.06 
 
 
268 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  73.09 
 
 
264 aa  361  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  70.43 
 
 
264 aa  360  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  74.06 
 
 
263 aa  360  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  70.92 
 
 
265 aa  356  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  71.02 
 
 
256 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  72.69 
 
 
244 aa  348  7e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  72.18 
 
 
251 aa  344  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  73.22 
 
 
255 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  73.22 
 
 
250 aa  342  4e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  66.42 
 
 
268 aa  342  5e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  68.87 
 
 
268 aa  336  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  68.44 
 
 
240 aa  333  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  65.16 
 
 
240 aa  331  9e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  70.08 
 
 
240 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  64.46 
 
 
239 aa  309  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  63.52 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  61.09 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  59.16 
 
 
289 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  62.96 
 
 
241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  60.67 
 
 
241 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  58.61 
 
 
241 aa  301  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  62.4 
 
 
282 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  61.69 
 
 
247 aa  301  8.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  60.15 
 
 
290 aa  301  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  60.38 
 
 
289 aa  301  9e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  60.62 
 
 
282 aa  300  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  58.61 
 
 
246 aa  299  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  55.3 
 
 
265 aa  299  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  63.37 
 
 
283 aa  299  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  54.91 
 
 
271 aa  299  3e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  57.79 
 
 
241 aa  298  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  57.38 
 
 
241 aa  296  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.02 
 
 
241 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.79 
 
 
241 aa  296  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 
241 aa  296  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  56.98 
 
 
259 aa  295  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.02 
 
 
241 aa  295  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  54.55 
 
 
265 aa  295  5e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  58.3 
 
 
258 aa  293  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  58.61 
 
 
241 aa  293  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  58.53 
 
 
258 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  58.2 
 
 
241 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  60.58 
 
 
240 aa  293  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  58.78 
 
 
250 aa  293  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  58.2 
 
 
241 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  62.81 
 
 
263 aa  292  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  57.79 
 
 
241 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  56.02 
 
 
261 aa  292  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  61.57 
 
 
239 aa  292  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  60.17 
 
 
254 aa  291  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  59.84 
 
 
241 aa  291  7e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  59.84 
 
 
241 aa  291  7e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  59.43 
 
 
241 aa  291  7e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  61.32 
 
 
240 aa  290  1e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  58.2 
 
 
241 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  57.79 
 
 
241 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.79 
 
 
241 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  57.79 
 
 
241 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  60.91 
 
 
240 aa  289  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  58.16 
 
 
241 aa  289  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  57.89 
 
 
317 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  57.2 
 
 
243 aa  288  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  57.79 
 
 
241 aa  288  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2417  ABC transporter related  60.25 
 
 
241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0204694 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  57.2 
 
 
288 aa  287  9e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  57.96 
 
 
310 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  55.6 
 
 
332 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  56.4 
 
 
252 aa  287  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  58.37 
 
 
316 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  55.68 
 
 
311 aa  287  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  58.85 
 
 
244 aa  287  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.79 
 
 
241 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  57.89 
 
 
314 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>