More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0656 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  100 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  88.99 
 
 		 317 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  85.49 
 
 		 316 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  80.06 
 
 		 332 aa  498  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  84.44 
 
 		 317 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  77.95 
 
 		 333 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  73.35 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  74.9 
 
 		 282 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  75.11 
 
 		 310 aa  368  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  75.72 
 
 		 283 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  74.51 
 
 		 282 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  67.74 
 
 		 289 aa  362  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  75.31 
 
 		 289 aa  361  9e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  75.31 
 
 		 290 aa  361  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  72.8 
 
 		 254 aa  359  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  73.22 
 
 		 279 aa  358  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  72.8 
 
 		 277 aa  358  7e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  72.84 
 
 		 311 aa  358  7e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  65.41 
 
 		 268 aa  356  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  67.44 
 
 		 258 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  67.86 
 
 		 258 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  71.19 
 
 		 261 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  70.12 
 
 		 321 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  73.84 
 
 		 267 aa  349  4e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  70.46 
 
 		 264 aa  346  4e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  69.29 
 
 		 270 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  71.73 
 
 		 263 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  62.65 
 
 		 253 aa  325  6e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  62.01 
 
 		 288 aa  323  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  62.92 
 
 		 256 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  68.7 
 
 		 264 aa  321  9.000000000000001e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  64.02 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  59.47 
 
 		 258 aa  308  6.999999999999999e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  59.27 
 
 		 271 aa  305  6e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  61.57 
 
 		 252 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  60.42 
 
 		 249 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  54.55 
 
 		 268 aa  298  7e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  58.27 
 
 		 268 aa  298  9e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  61.57 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  55.02 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  55.02 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  61.16 
 
 		 255 aa  296  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  59.49 
 
 		 244 aa  296  4e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  61.32 
 
 		 268 aa  295  9e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  59.18 
 
 		 262 aa  294  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  58.4 
 
 		 241 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.98 
 
 		 241 aa  293  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  61.18 
 
 		 253 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  57.47 
 
 		 264 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  60.76 
 
 		 244 aa  292  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  60.76 
 
 		 253 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  60.76 
 
 		 253 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  59.07 
 
 		 244 aa  292  5e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  60.08 
 
 		 241 aa  292  6e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  60.08 
 
 		 241 aa  292  6e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  61.09 
 
 		 251 aa  291  7e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  58.4 
 
 		 241 aa  291  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  55.72 
 
 		 266 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  59.07 
 
 		 240 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  56.72 
 
 		 241 aa  291  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  56.37 
 
 		 264 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  59.92 
 
 		 263 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  60.76 
 
 		 254 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  59.43 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  58.4 
 
 		 241 aa  289  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  58.14 
 
 		 265 aa  289  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  57.81 
 
 		 244 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  57.03 
 
 		 263 aa  288  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  57.14 
 
 		 247 aa  288  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  60.92 
 
 		 247 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  54.85 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  58.23 
 
 		 244 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  57.5 
 
 		 244 aa  285  8e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.81 
 
 		 241 aa  285  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  57.14 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  54.1 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  54.48 
 
 		 260 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  55.77 
 
 		 258 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  58.4 
 
 		 241 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  57.56 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  55.7 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  57.32 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  59.57 
 
 		 241 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  56.54 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  56.52 
 
 		 246 aa  282  6.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  56.3 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  57.98 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.14 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 258 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  57.51 
 
 		 246 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  59.07 
 
 		 244 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  57.61 
 
 		 256 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 258 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  55.7 
 
 		 244 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 258 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 258 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 241 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 258 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 258 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>