More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4226 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 268 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  86.59 
 
 		 251 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  72.76 
 
 		 268 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  77.14 
 
 		 265 aa  387  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  77.05 
 
 		 263 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  77.11 
 
 		 264 aa  381  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  71.76 
 
 		 264 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  77.14 
 
 		 256 aa  378  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  75.1 
 
 		 262 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  70.93 
 
 		 262 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  70.93 
 
 		 262 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  75.1 
 
 		 255 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  69.92 
 
 		 258 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  75.1 
 
 		 250 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  70.97 
 
 		 261 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  69.53 
 
 		 258 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  69.53 
 
 		 258 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  70.97 
 
 		 261 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  68.75 
 
 		 258 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  68.75 
 
 		 258 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  68.75 
 
 		 258 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  68.75 
 
 		 258 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  68.75 
 
 		 258 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  68.75 
 
 		 258 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  68.75 
 
 		 258 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  68.75 
 
 		 258 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  72.58 
 
 		 262 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  69.53 
 
 		 258 aa  353  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  69.92 
 
 		 258 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  67.91 
 
 		 260 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  69.53 
 
 		 258 aa  352  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  69.53 
 
 		 258 aa  351  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  69.77 
 
 		 263 aa  344  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  67.87 
 
 		 268 aa  338  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  67.86 
 
 		 255 aa  337  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  68.87 
 
 		 266 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  67.87 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  69.14 
 
 		 255 aa  329  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  64.49 
 
 		 240 aa  322  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  64.9 
 
 		 240 aa  321  6e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  69.8 
 
 		 240 aa  321  8e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  65.84 
 
 		 247 aa  318  7e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  61.94 
 
 		 316 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  60.38 
 
 		 317 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.62 
 
 		 336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  59.92 
 
 		 332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  62.7 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  62.7 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  63.31 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  63.31 
 
 		 282 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  61.32 
 
 		 243 aa  301  9e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  63.27 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  58.78 
 
 		 333 aa  299  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 		 241 aa  299  4e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  60.23 
 
 		 289 aa  299  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  60 
 
 		 317 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  62.25 
 
 		 289 aa  298  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  61.73 
 
 		 240 aa  298  6e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  62.25 
 
 		 290 aa  298  9e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  58.44 
 
 		 241 aa  297  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  62.04 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  58.91 
 
 		 321 aa  296  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  60.57 
 
 		 314 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  57.56 
 
 		 279 aa  295  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  59.92 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  61.73 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  59.67 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.61 
 
 		 241 aa  294  9e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.67 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.4 
 
 		 268 aa  293  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.67 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.67 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.67 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.67 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  59.26 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  58.91 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  59.51 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  57.89 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  58.91 
 
 		 277 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  63.37 
 
 		 241 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.67 
 
 		 241 aa  293  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  58.17 
 
 		 247 aa  293  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  61.73 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  62.14 
 
 		 239 aa  292  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  57.84 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  62.14 
 
 		 270 aa  292  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.67 
 
 		 241 aa  291  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  59.18 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  59.18 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  60.41 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  60.32 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  60.49 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  60 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  61.32 
 
 		 261 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.49 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  56.79 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  57.49 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  58.3 
 
 		 256 aa  288  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  58.44 
 
 		 243 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>