More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1673 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  100 
 
 
264 aa  520  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  78.28 
 
 
263 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  73.95 
 
 
288 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  73.95 
 
 
267 aa  354  8.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  70.46 
 
 
333 aa  332  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  67.51 
 
 
254 aa  332  6e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  67.51 
 
 
277 aa  331  9e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  64.14 
 
 
253 aa  329  3e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  64.78 
 
 
279 aa  328  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  64.32 
 
 
252 aa  327  9e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  64.63 
 
 
270 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  66.8 
 
 
316 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  68.35 
 
 
332 aa  325  5e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  65.42 
 
 
244 aa  325  5e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  67.07 
 
 
336 aa  323  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  67.51 
 
 
317 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  64 
 
 
253 aa  322  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  64 
 
 
253 aa  322  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  65.82 
 
 
253 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  68.7 
 
 
317 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  68.7 
 
 
314 aa  321  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  67.67 
 
 
321 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  66.39 
 
 
254 aa  320  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  63.39 
 
 
310 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  63.6 
 
 
261 aa  319  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  67.09 
 
 
283 aa  318  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  62.96 
 
 
249 aa  317  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  64.32 
 
 
311 aa  315  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  64.92 
 
 
289 aa  314  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  65.71 
 
 
282 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  61.86 
 
 
256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  64.26 
 
 
290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  64.71 
 
 
282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  64.14 
 
 
258 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  61.25 
 
 
264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  64.37 
 
 
289 aa  311  9e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  63.71 
 
 
258 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  63.6 
 
 
271 aa  310  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  61.25 
 
 
268 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  61.07 
 
 
258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  60.83 
 
 
267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  58.23 
 
 
244 aa  295  4e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  60.08 
 
 
264 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  59.68 
 
 
268 aa  291  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  58.82 
 
 
241 aa  291  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  58.4 
 
 
243 aa  291  9e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  60.76 
 
 
249 aa  289  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  60.08 
 
 
258 aa  289  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  60.49 
 
 
258 aa  288  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  59.15 
 
 
268 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  60.49 
 
 
261 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  58.4 
 
 
241 aa  288  7e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  60.08 
 
 
258 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  60.08 
 
 
258 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  60.08 
 
 
258 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  58.96 
 
 
262 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  56.12 
 
 
244 aa  287  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  59.67 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  58.85 
 
 
262 aa  287  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  57.38 
 
 
244 aa  286  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  60 
 
 
258 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  58.37 
 
 
265 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  58.06 
 
 
262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  60.49 
 
 
260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  58.06 
 
 
262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  58.78 
 
 
263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  59.67 
 
 
261 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  59.67 
 
 
258 aa  285  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  56.06 
 
 
268 aa  285  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  60.08 
 
 
258 aa  285  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  56.54 
 
 
244 aa  285  5e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 
241 aa  284  9e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 
246 aa  284  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  58.82 
 
 
241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  58.82 
 
 
241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  57.56 
 
 
241 aa  281  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  56.96 
 
 
241 aa  281  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  59.76 
 
 
255 aa  281  6.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  60.74 
 
 
255 aa  281  7.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  58.85 
 
 
263 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  57.81 
 
 
244 aa  281  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  57.81 
 
 
266 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  56.96 
 
 
239 aa  281  8.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  56.12 
 
 
243 aa  281  8.000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  60.5 
 
 
239 aa  281  9e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  57.76 
 
 
254 aa  280  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.32 
 
 
241 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  58.33 
 
 
246 aa  279  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  54.85 
 
 
244 aa  279  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 
246 aa  278  5e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  56.9 
 
 
241 aa  278  6e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  57.32 
 
 
249 aa  278  7e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 
249 aa  278  7e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  56.4 
 
 
264 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>