More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0868 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  513  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  79.32 
 
 		 245 aa  388  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  78.75 
 
 		 243 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  77.08 
 
 		 243 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  73.14 
 
 		 243 aa  373  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  72.31 
 
 		 246 aa  367  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  72.31 
 
 		 246 aa  364  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  73.33 
 
 		 244 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  71.49 
 
 		 251 aa  358  6e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  70.85 
 
 		 247 aa  358  7e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  67.36 
 
 		 244 aa  338  4e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  66.26 
 
 		 244 aa  335  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  65.84 
 
 		 244 aa  330  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  65.84 
 
 		 244 aa  327  9e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  63.79 
 
 		 244 aa  324  8.000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  63.37 
 
 		 244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  63.79 
 
 		 244 aa  318  5e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  62.08 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0513  ATPase  61.07 
 
 		 250 aa  309  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.911954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  61.51 
 
 		 239 aa  303  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  62.34 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  59.5 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  58.09 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  57.98 
 
 		 249 aa  299  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  60.42 
 
 		 241 aa  299  4e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1638  ABC transporter-like  61.67 
 
 		 242 aa  298  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0878817  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  59.49 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  60.5 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  60.78 
 
 		 310 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  57.45 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  60.43 
 
 		 253 aa  295  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  59.75 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  60 
 
 		 245 aa  292  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  59.57 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  59.57 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  57.5 
 
 		 247 aa  292  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  58.65 
 
 		 265 aa  292  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  59.75 
 
 		 262 aa  291  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  60.17 
 
 		 266 aa  291  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  59.75 
 
 		 262 aa  291  5e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  59.92 
 
 		 289 aa  291  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  58.37 
 
 		 321 aa  291  6e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  60.08 
 
 		 242 aa  291  7e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  59.83 
 
 		 277 aa  291  7e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  59.49 
 
 		 289 aa  290  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  58.92 
 
 		 246 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  58.55 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  58.47 
 
 		 247 aa  291  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  59.49 
 
 		 290 aa  290  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  58.65 
 
 		 265 aa  290  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  60.17 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  58.12 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  58.37 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.58 
 
 		 336 aa  289  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  60.59 
 
 		 249 aa  288  4e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  60.59 
 
 		 249 aa  288  4e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  58.12 
 
 		 241 aa  289  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  57.38 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  57.61 
 
 		 255 aa  288  8e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4389  ABC transporter-like protein protein  59.58 
 
 		 242 aa  287  9e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  59.49 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  59.4 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  58.58 
 
 		 282 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  60.34 
 
 		 283 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  56.72 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 		 332 aa  286  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  59.07 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  58.65 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  58.65 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  58.65 
 
 		 258 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  59.07 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  56.6 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  58.12 
 
 		 259 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  59.23 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  59.57 
 
 		 333 aa  285  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  58.65 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  58.58 
 
 		 316 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  58.65 
 
 		 258 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  59.05 
 
 		 247 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  57.5 
 
 		 243 aa  284  8e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  57.98 
 
 		 259 aa  284  9e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  58.23 
 
 		 258 aa  284  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  57.26 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  58.19 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  55.98 
 
 		 240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  58.65 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  55.6 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  57.08 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  58.65 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  59.91 
 
 		 288 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  56.22 
 
 		 271 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  58.26 
 
 		 263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  57.74 
 
 		 241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  57.2 
 
 		 255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  62.34 
 
 		 245 aa  281  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  57.76 
 
 		 258 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  54.55 
 
 		 262 aa  281  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  56.65 
 
 		 267 aa  282  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  58.58 
 
 		 282 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>