More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2167 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  502  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  73.68 
 
 		 247 aa  363  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  70.71 
 
 		 246 aa  342  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0868  ABC transporter related protein  70.04 
 
 		 245 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  69.55 
 
 		 246 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3391  ABC transporter related  69.64 
 
 		 245 aa  333  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  69.2 
 
 		 246 aa  331  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  65.83 
 
 		 241 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  61.25 
 
 		 241 aa  304  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  62.55 
 
 		 242 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 246 aa  302  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  59.66 
 
 		 241 aa  301  5.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  62.55 
 
 		 240 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  59.34 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  60.34 
 
 		 310 aa  296  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  60.76 
 
 		 282 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 241 aa  295  3e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  59.24 
 
 		 239 aa  294  8e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  59.83 
 
 		 241 aa  294  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  60.08 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  58.65 
 
 		 240 aa  294  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  60.25 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  60.17 
 
 		 243 aa  293  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  58.17 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  60.08 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 		 241 aa  292  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 241 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  58.4 
 
 		 241 aa  292  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  60.08 
 
 		 243 aa  292  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  57.81 
 
 		 244 aa  291  6e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  58.4 
 
 		 241 aa  291  8e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  59.83 
 
 		 241 aa  291  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  57.81 
 
 		 244 aa  291  9e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  58.78 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  58.61 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  58.78 
 
 		 262 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  59.66 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  59.66 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  59.66 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  59.66 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  58.78 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  59.41 
 
 		 241 aa  289  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  58.23 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  59.41 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  59.41 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  59.41 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  59.83 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  59.41 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  61.18 
 
 		 289 aa  288  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  59.41 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  59 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.49 
 
 		 336 aa  288  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  60.91 
 
 		 245 aa  288  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  59.92 
 
 		 332 aa  288  7e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 241 aa  288  7e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  59.41 
 
 		 241 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  59.49 
 
 		 333 aa  288  7e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  60.08 
 
 		 243 aa  288  8e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  58.7 
 
 		 290 aa  288  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  57.38 
 
 		 244 aa  288  8e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  60.76 
 
 		 289 aa  288  8e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  57.85 
 
 		 314 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  58.58 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.4 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  59.07 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.58 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  59.66 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0507  ABC transporter-related protein  61.64 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.302089  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  58.23 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  60.08 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.58 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.4 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  57.79 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  59.84 
 
 		 244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  58.23 
 
 		 240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  59.15 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  58.65 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  57.32 
 
 		 261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  57.6 
 
 		 251 aa  285  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  56.91 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  52.32 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.74 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.74 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.74 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.74 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.74 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  59.24 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  57.14 
 
 		 268 aa  285  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  57.89 
 
 		 264 aa  285  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  58.44 
 
 		 256 aa  285  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  59.05 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  59.92 
 
 		 283 aa  285  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  56.56 
 
 		 317 aa  284  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  57.5 
 
 		 316 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  57.98 
 
 		 243 aa  284  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  56.72 
 
 		 241 aa  284  8e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  60.67 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  56.54 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  57.32 
 
 		 260 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  54.85 
 
 		 247 aa  283  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>