More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0868 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0868  ABC transporter related protein  100 
 
 
245 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3391  ABC transporter related  99.18 
 
 
245 aa  488  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  80.89 
 
 
246 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  78.57 
 
 
246 aa  384  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  75.2 
 
 
246 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  70.04 
 
 
247 aa  347  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  70.89 
 
 
247 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  67.09 
 
 
241 aa  330  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  62.45 
 
 
245 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.08 
 
 
241 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.08 
 
 
241 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.08 
 
 
241 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.08 
 
 
241 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.08 
 
 
241 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.67 
 
 
241 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  59.58 
 
 
241 aa  299  3e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  56.97 
 
 
250 aa  299  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  59.17 
 
 
241 aa  298  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  58.75 
 
 
241 aa  297  8e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  58.4 
 
 
241 aa  297  9e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
246 aa  297  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.92 
 
 
241 aa  297  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  59.41 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  59.04 
 
 
264 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  58.4 
 
 
239 aa  296  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  60.25 
 
 
244 aa  295  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60 
 
 
241 aa  295  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  60 
 
 
241 aa  295  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.17 
 
 
241 aa  294  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
241 aa  293  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  59 
 
 
244 aa  293  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.42 
 
 
241 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  59.58 
 
 
241 aa  292  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  58.33 
 
 
241 aa  291  5e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  57.92 
 
 
244 aa  291  6e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  58.33 
 
 
241 aa  291  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  60 
 
 
241 aa  290  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  58.65 
 
 
254 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0507  ABC transporter-related protein  59.41 
 
 
240 aa  289  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.302089  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  56.07 
 
 
240 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  60.25 
 
 
310 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  58.75 
 
 
241 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  57.38 
 
 
243 aa  290  2e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.25 
 
 
241 aa  289  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  60.67 
 
 
243 aa  289  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  57.6 
 
 
262 aa  288  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  57.6 
 
 
262 aa  288  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  59.83 
 
 
244 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  61.25 
 
 
241 aa  288  6e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  61.25 
 
 
241 aa  288  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.25 
 
 
241 aa  288  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.25 
 
 
241 aa  288  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.25 
 
 
241 aa  288  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.25 
 
 
241 aa  288  6e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  60.25 
 
 
243 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  61.25 
 
 
241 aa  288  6e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  60.09 
 
 
241 aa  288  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  60.25 
 
 
243 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  60.25 
 
 
243 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  60.25 
 
 
243 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.25 
 
 
241 aa  288  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
243 aa  288  7e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  56.63 
 
 
261 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  56.85 
 
 
262 aa  288  8e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  60.25 
 
 
243 aa  287  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  60.25 
 
 
243 aa  287  8e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  60.25 
 
 
243 aa  287  8e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  59.58 
 
 
241 aa  287  9e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  59.58 
 
 
241 aa  287  9e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  59.75 
 
 
243 aa  287  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  57.03 
 
 
261 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  60.25 
 
 
243 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  57.96 
 
 
268 aa  286  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  57.74 
 
 
244 aa  286  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  59.59 
 
 
268 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  58.37 
 
 
262 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.33 
 
 
241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.33 
 
 
241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  57.5 
 
 
249 aa  285  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  57.5 
 
 
249 aa  285  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  54.85 
 
 
246 aa  285  2.9999999999999996e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  62.15 
 
 
241 aa  285  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  60.92 
 
 
243 aa  285  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  55.78 
 
 
265 aa  285  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  62.15 
 
 
241 aa  285  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  56.22 
 
 
258 aa  284  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  56.22 
 
 
258 aa  284  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  56.9 
 
 
240 aa  284  9e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  56.9 
 
 
244 aa  284  9e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  56.22 
 
 
258 aa  284  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  58.33 
 
 
241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  57.92 
 
 
241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  57.26 
 
 
268 aa  283  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  56.07 
 
 
252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  56.72 
 
 
244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  58.33 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  62.76 
 
 
240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.33 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  56.63 
 
 
260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  56.22 
 
 
258 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>