More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3335 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  497  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  59.5 
 
 		 246 aa  308  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  64.17 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  63.33 
 
 		 241 aa  305  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  58.4 
 
 		 241 aa  304  9.000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  60.25 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  59.41 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  60.41 
 
 		 262 aa  300  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  59.76 
 
 		 268 aa  300  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  58.4 
 
 		 241 aa  299  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  57.98 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  57.87 
 
 		 262 aa  298  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  57.02 
 
 		 246 aa  298  6e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  57.87 
 
 		 262 aa  298  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  60.5 
 
 		 239 aa  298  6e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  59 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  58.85 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  56.47 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  57.92 
 
 		 241 aa  296  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  58.37 
 
 		 255 aa  296  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  59.59 
 
 		 263 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  57.74 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  57.5 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  60.16 
 
 		 258 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  60.16 
 
 		 258 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  56.3 
 
 		 243 aa  293  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  60.16 
 
 		 258 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  60.16 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  60.16 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  58.78 
 
 		 266 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  60.16 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  60.16 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  57.56 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  60.16 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  60.16 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  60.16 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  60.16 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  60.16 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  60.16 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  59.76 
 
 		 258 aa  292  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  56.67 
 
 		 241 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  59.76 
 
 		 258 aa  291  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  59.35 
 
 		 261 aa  291  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  55.91 
 
 		 264 aa  291  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  58.94 
 
 		 261 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  57.03 
 
 		 265 aa  291  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  60.92 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  63.18 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  58.23 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  57.14 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  57.14 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  57.81 
 
 		 246 aa  288  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  58.16 
 
 		 240 aa  289  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 		 246 aa  289  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  55.83 
 
 		 244 aa  288  4e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  59.83 
 
 		 240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2417  ABC transporter related  57.98 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204694 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  57.5 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  57.5 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  56.18 
 
 		 264 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  56.85 
 
 		 268 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  57.14 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  57.14 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  57.14 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  56.72 
 
 		 247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  56.67 
 
 		 241 aa  288  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  56.25 
 
 		 241 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  60.34 
 
 		 241 aa  288  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  60.34 
 
 		 241 aa  288  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  59.11 
 
 		 260 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  58.37 
 
 		 245 aa  288  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  57.14 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  56.45 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  57.14 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  57.14 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  57.14 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  55.42 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  56.79 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3391  ABC transporter related  56.97 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  59.41 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0868  ABC transporter related protein  56.97 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 		 243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  55.65 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  59.66 
 
 		 247 aa  285  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  54.69 
 
 		 259 aa  285  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  56.67 
 
 		 242 aa  285  5e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  55.95 
 
 		 271 aa  285  7e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  54.69 
 
 		 277 aa  284  9e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  55.88 
 
 		 246 aa  284  9e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  56.56 
 
 		 263 aa  284  9e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  54.62 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  55.92 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>