More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2070 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  64.58 
 
 		 246 aa  321  8e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  62.4 
 
 		 246 aa  308  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  62.96 
 
 		 246 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0868  ABC transporter related protein  62.45 
 
 		 245 aa  298  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3391  ABC transporter related  62.45 
 
 		 245 aa  297  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  60.25 
 
 		 241 aa  292  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  60.91 
 
 		 247 aa  288  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  58.37 
 
 		 250 aa  288  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  57.98 
 
 		 239 aa  287  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  57.81 
 
 		 244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  60.42 
 
 		 242 aa  285  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  56.96 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  58.82 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.94 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  55.79 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  55.65 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  61.18 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  56.72 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0507  ABC transporter-related protein  57.81 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.302089  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  55.51 
 
 		 265 aa  275  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  55.82 
 
 		 258 aa  274  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  58.12 
 
 		 259 aa  274  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  58.23 
 
 		 241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  58.23 
 
 		 241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  56.33 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  57.69 
 
 		 254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  58.19 
 
 		 310 aa  272  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  58.33 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  56.5 
 
 		 258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  56.5 
 
 		 258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  56.5 
 
 		 258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  56.15 
 
 		 244 aa  272  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  56.05 
 
 		 255 aa  271  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  56.79 
 
 		 321 aa  271  6e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  56.05 
 
 		 263 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  57.38 
 
 		 263 aa  270  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  56.5 
 
 		 258 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  54.7 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.07 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  56.07 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  54.2 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  55.92 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  54.85 
 
 		 240 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  55.56 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  55.74 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  51.48 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  53.91 
 
 		 268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  55.74 
 
 		 261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  56.07 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  55.92 
 
 		 260 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1236  ABC transporter related protein  54.2 
 
 		 245 aa  268  5e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.839262  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  56.05 
 
 		 255 aa  268  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  51.45 
 
 		 243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  54.81 
 
 		 243 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  54.81 
 
 		 243 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  54.81 
 
 		 243 aa  268  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  55.47 
 
 		 266 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  55.28 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  54.92 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  55 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  57.33 
 
 		 288 aa  267  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  55.46 
 
 		 279 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  55.65 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.97 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  55.1 
 
 		 277 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  57.02 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.56 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4299  ABC transporter-related protein  56.54 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  54.88 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  53.59 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  53.56 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  56.72 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  55.24 
 
 		 262 aa  265  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  55.24 
 
 		 262 aa  265  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  55.23 
 
 		 241 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 264 aa  265  4e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  54.94 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  55.1 
 
 		 254 aa  265  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  55.19 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  53.16 
 
 		 243 aa  264  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  55.83 
 
 		 259 aa  264  8e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  53.97 
 
 		 243 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  53.97 
 
 		 243 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  54.39 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  53.63 
 
 		 262 aa  263  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  53.97 
 
 		 243 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  50.63 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  58.65 
 
 		 283 aa  264  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  55.97 
 
 		 268 aa  263  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  55.46 
 
 		 263 aa  263  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>