More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0826 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  100 
 
 
271 aa  557  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  82.33 
 
 
265 aa  421  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  81.89 
 
 
265 aa  423  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  67.65 
 
 
241 aa  343  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  66.95 
 
 
241 aa  328  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  67.81 
 
 
241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  65.4 
 
 
241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  68.22 
 
 
241 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  66.95 
 
 
241 aa  326  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 
246 aa  325  5e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  65.56 
 
 
243 aa  325  6e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  66.95 
 
 
241 aa  324  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  67.22 
 
 
243 aa  324  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  66.09 
 
 
241 aa  323  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  66.95 
 
 
241 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  66.95 
 
 
241 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  66.52 
 
 
241 aa  322  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  66.52 
 
 
241 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  64.14 
 
 
241 aa  322  6e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  66.52 
 
 
241 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  66.09 
 
 
241 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  64.81 
 
 
241 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  68.24 
 
 
243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  69.1 
 
 
243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  64.81 
 
 
241 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  69.1 
 
 
243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  69.1 
 
 
243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  69.1 
 
 
243 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  64.81 
 
 
241 aa  319  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  68.67 
 
 
243 aa  319  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  68.67 
 
 
243 aa  319  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  68.67 
 
 
243 aa  319  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  65.15 
 
 
243 aa  317  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  66.53 
 
 
243 aa  314  9e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  68.67 
 
 
243 aa  314  9e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  64.73 
 
 
243 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  62.2 
 
 
259 aa  314  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  65.56 
 
 
243 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  66.52 
 
 
243 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.29 
 
 
241 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.29 
 
 
241 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.29 
 
 
241 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.29 
 
 
241 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.29 
 
 
241 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  61.02 
 
 
241 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  62.23 
 
 
241 aa  310  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.29 
 
 
241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  63.09 
 
 
241 aa  308  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  62.93 
 
 
241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  63.71 
 
 
241 aa  305  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  63.71 
 
 
241 aa  305  6e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.71 
 
 
241 aa  305  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.71 
 
 
241 aa  305  6e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.71 
 
 
241 aa  305  6e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.71 
 
 
241 aa  305  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  63.71 
 
 
241 aa  305  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.71 
 
 
241 aa  305  6e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.23 
 
 
241 aa  304  9.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2417  ABC transporter related  66.09 
 
 
241 aa  304  9.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0204694 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.23 
 
 
241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.29 
 
 
241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.18 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.18 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  54.91 
 
 
266 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2714  ABC transporter related  63.95 
 
 
241 aa  299  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  61.86 
 
 
249 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  61.86 
 
 
249 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  58.06 
 
 
263 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0506  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.5 
 
 
241 aa  295  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.503338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.52 
 
 
241 aa  295  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1152  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.5 
 
 
241 aa  295  5e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0442  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.5 
 
 
241 aa  295  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  59.23 
 
 
239 aa  295  7e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  61.64 
 
 
241 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  61.64 
 
 
241 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  55.12 
 
 
262 aa  292  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  55.12 
 
 
262 aa  292  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  59.07 
 
 
241 aa  292  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  60.94 
 
 
241 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  58.65 
 
 
242 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  57.77 
 
 
265 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  56.5 
 
 
262 aa  289  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  59.91 
 
 
247 aa  289  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  57.94 
 
 
240 aa  288  7e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  56.4 
 
 
258 aa  288  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  56.4 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  55.6 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  57.81 
 
 
239 aa  287  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  57.68 
 
 
255 aa  287  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  56.4 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  56.4 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 
258 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  57.51 
 
 
240 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  56.4 
 
 
258 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>