More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1939 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  66.24 
 
 		 246 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  65.82 
 
 		 246 aa  321  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3391  ABC transporter related  67.09 
 
 		 245 aa  321  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0868  ABC transporter related protein  67.09 
 
 		 245 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  65.69 
 
 		 246 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  65.55 
 
 		 247 aa  316  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  65.83 
 
 		 247 aa  314  9e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  61.76 
 
 		 241 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  58.09 
 
 		 254 aa  300  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  58.51 
 
 		 244 aa  299  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  57.26 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  58.82 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  58.51 
 
 		 244 aa  298  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  58.4 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.98 
 
 		 241 aa  295  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  57.92 
 
 		 250 aa  296  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  60.25 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  62.18 
 
 		 242 aa  295  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  60.76 
 
 		 310 aa  295  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  57.26 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  55.04 
 
 		 246 aa  293  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  57.98 
 
 		 243 aa  294  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  56.54 
 
 		 243 aa  294  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  57.68 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  60.25 
 
 		 245 aa  292  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  59.57 
 
 		 268 aa  291  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  59.66 
 
 		 249 aa  291  5e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  59.66 
 
 		 249 aa  291  5e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  61 
 
 		 241 aa  291  7e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  54.85 
 
 		 243 aa  291  9e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0507  ABC transporter-related protein  60.34 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.302089  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4299  ABC transporter-related protein  60.76 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  59.5 
 
 		 259 aa  289  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  55.6 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  58.82 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  56.02 
 
 		 244 aa  288  6e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  58.58 
 
 		 240 aa  286  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  55.7 
 
 		 245 aa  287  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  57.98 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  55.7 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  57.98 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.49 
 
 		 336 aa  285  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4313  ABC transporter related  60.34 
 
 		 251 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  53.78 
 
 		 246 aa  284  8e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  59.43 
 
 		 268 aa  284  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  58.85 
 
 		 262 aa  283  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.56 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.56 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.56 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  59.57 
 
 		 314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.56 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.56 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.98 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  56.6 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  57.98 
 
 		 243 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  57.56 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  57.68 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  56.12 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  55.88 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  56.2 
 
 		 243 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  57.5 
 
 		 316 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  57.98 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  57.81 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  56.96 
 
 		 264 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.74 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  56.54 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  60.5 
 
 		 241 aa  281  6.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.56 
 
 		 241 aa  281  6.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  58.13 
 
 		 268 aa  281  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  58.4 
 
 		 244 aa  281  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  53.36 
 
 		 247 aa  281  7.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  56.72 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  57.81 
 
 		 317 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  57.98 
 
 		 243 aa  281  9e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  57.98 
 
 		 243 aa  281  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  57.98 
 
 		 243 aa  281  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  56.96 
 
 		 267 aa  281  9e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  57.98 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  58.82 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  58.82 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  57.98 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  58.87 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  57.81 
 
 		 317 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  56.54 
 
 		 249 aa  281  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  57.98 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  57.98 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  56.96 
 
 		 277 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  58.65 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  56.1 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  56.97 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>