More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0507 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0507  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.302089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  64.98 
 
 		 246 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  60.34 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  57.94 
 
 		 243 aa  286  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  61.64 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  59.91 
 
 		 246 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  57.68 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 		 241 aa  284  7e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  57.26 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  57.5 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  57.81 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  57.5 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  57.08 
 
 		 241 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3391  ABC transporter related  59.83 
 
 		 245 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  55.19 
 
 		 241 aa  281  7.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  58.82 
 
 		 246 aa  281  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  57.08 
 
 		 240 aa  281  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  55.19 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  55.19 
 
 		 241 aa  279  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  56.9 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.85 
 
 		 241 aa  278  7e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0868  ABC transporter related protein  59.41 
 
 		 245 aa  278  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  55.56 
 
 		 250 aa  277  8e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.43 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  54.17 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  57.81 
 
 		 245 aa  276  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  55.7 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  54.36 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  274  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  54.77 
 
 		 241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  57.56 
 
 		 243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  57.56 
 
 		 243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  57.56 
 
 		 243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  57.56 
 
 		 243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  57.26 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  55.19 
 
 		 241 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  55.56 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  54.43 
 
 		 254 aa  272  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  56.02 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  57.56 
 
 		 243 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  57.56 
 
 		 243 aa  273  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.02 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  57.56 
 
 		 243 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  55.6 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  52.59 
 
 		 245 aa  271  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  53.53 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  51.68 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  56.72 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  55.23 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  51.48 
 
 		 247 aa  268  4e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  55.46 
 
 		 243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  56.84 
 
 		 243 aa  268  8e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  55 
 
 		 244 aa  268  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  56.61 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  56.07 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  51.26 
 
 		 243 aa  266  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  53.33 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  53.56 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  54.32 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  57.92 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  54.32 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  54.73 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  54.73 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  53.94 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  54.32 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  55.97 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  54.73 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  53.91 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  53.97 
 
 		 244 aa  265  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  54.74 
 
 		 244 aa  265  4e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  54.32 
 
 		 262 aa  265  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4313  ABC transporter related  54.31 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  50.86 
 
 		 246 aa  265  5e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  55 
 
 		 240 aa  265  5.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2417  ABC transporter related  56.85 
 
 		 241 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  53.85 
 
 		 264 aa  264  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  54.73 
 
 		 258 aa  265  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  56.43 
 
 		 241 aa  264  8e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  56.43 
 
 		 241 aa  264  8e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.43 
 
 		 241 aa  264  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.43 
 
 		 241 aa  264  8e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.43 
 
 		 241 aa  264  8e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.43 
 
 		 241 aa  264  8e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  56.43 
 
 		 241 aa  264  8e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.43 
 
 		 241 aa  264  8e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>