More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2125 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  72.61 
 
 		 241 aa  338  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  65.56 
 
 		 241 aa  334  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  68.46 
 
 		 241 aa  332  3e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  63.07 
 
 		 241 aa  329  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  63.49 
 
 		 241 aa  329  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  63.9 
 
 		 241 aa  329  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  64.32 
 
 		 241 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  64.73 
 
 		 241 aa  329  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  64.73 
 
 		 241 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  64.73 
 
 		 241 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  63.9 
 
 		 241 aa  328  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  63.9 
 
 		 241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  64.73 
 
 		 241 aa  325  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  64.44 
 
 		 246 aa  325  5e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  69.33 
 
 		 239 aa  323  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  64.17 
 
 		 243 aa  323  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  61.83 
 
 		 241 aa  323  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  63.07 
 
 		 241 aa  323  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  62.66 
 
 		 241 aa  322  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  68.2 
 
 		 240 aa  321  7e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  63.49 
 
 		 241 aa  319  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  63.49 
 
 		 241 aa  319  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  65.98 
 
 		 259 aa  319  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  68.49 
 
 		 239 aa  319  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  64.29 
 
 		 268 aa  318  6e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  62.66 
 
 		 241 aa  316  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  67.78 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  62.24 
 
 		 241 aa  315  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  62.66 
 
 		 241 aa  314  8e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  62.24 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2714  ABC transporter related  66.8 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  67.21 
 
 		 240 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  308  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  65 
 
 		 243 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  60.58 
 
 		 240 aa  307  9e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  61.41 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  66.52 
 
 		 242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  64.29 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.07 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.07 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  64.02 
 
 		 270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.07 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  66.39 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.07 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.07 
 
 		 241 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  63.37 
 
 		 255 aa  306  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.24 
 
 		 241 aa  305  6e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  63.33 
 
 		 243 aa  304  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  61.41 
 
 		 241 aa  304  7e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  62.55 
 
 		 262 aa  304  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  62.55 
 
 		 262 aa  304  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  62.96 
 
 		 262 aa  304  8.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  64.17 
 
 		 243 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  64.17 
 
 		 243 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  64.17 
 
 		 243 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  64.17 
 
 		 243 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  62.66 
 
 		 241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  63.75 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  63.75 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  63.75 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  60.92 
 
 		 265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  62.96 
 
 		 266 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  64.58 
 
 		 243 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.83 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  64.29 
 
 		 247 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  63.37 
 
 		 263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  61.34 
 
 		 265 aa  301  6.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  64.58 
 
 		 243 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  62.34 
 
 		 277 aa  300  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  63.79 
 
 		 268 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  65 
 
 		 243 aa  300  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  60.17 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  62.34 
 
 		 258 aa  299  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  62.55 
 
 		 255 aa  299  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.34 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  62.34 
 
 		 254 aa  299  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  63.87 
 
 		 289 aa  299  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  61.92 
 
 		 279 aa  299  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  60.42 
 
 		 254 aa  299  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  65.13 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  65 
 
 		 243 aa  298  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  62.34 
 
 		 258 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  63.45 
 
 		 289 aa  298  6e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  64.71 
 
 		 244 aa  297  8e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  63.45 
 
 		 290 aa  297  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  60.17 
 
 		 240 aa  297  9e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  62.76 
 
 		 261 aa  296  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  57.68 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  63.07 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.07 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  63.45 
 
 		 283 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3497  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.07 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.07 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0499  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.07 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406255  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  63.07 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  63.07 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>