More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1770 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1770  ATPase  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  75.73 
 
 		 241 aa  380  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  73.75 
 
 		 241 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  70 
 
 		 240 aa  344  7e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  68.62 
 
 		 242 aa  337  9e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  62.55 
 
 		 247 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  56.49 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.26 
 
 		 241 aa  294  7e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  59.07 
 
 		 243 aa  292  2e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  57.08 
 
 		 244 aa  292  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  57.56 
 
 		 243 aa  291  9e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.34 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  59.49 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.92 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.75 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  57.68 
 
 		 241 aa  289  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  56.72 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  57.38 
 
 		 254 aa  288  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  55.65 
 
 		 244 aa  288  7e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  56.78 
 
 		 245 aa  288  7e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  55.23 
 
 		 244 aa  287  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  57.68 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  56.72 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.92 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.92 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  56.54 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  57.38 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  56.49 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  57.83 
 
 		 247 aa  285  5.999999999999999e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  59.66 
 
 		 246 aa  284  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  58.26 
 
 		 255 aa  284  8e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  57.98 
 
 		 277 aa  284  9e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  57.26 
 
 		 259 aa  284  9e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  57.32 
 
 		 243 aa  284  9e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  55.6 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  55.88 
 
 		 256 aa  283  1.0000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  56.65 
 
 		 332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  54.77 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  55.19 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  54.77 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  56.67 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  55.83 
 
 		 271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.9 
 
 		 336 aa  281  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  57.81 
 
 		 241 aa  281  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  56.72 
 
 		 256 aa  281  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.92 
 
 		 241 aa  281  7.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0507  ABC transporter-related protein  57.08 
 
 		 240 aa  281  9e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.302089  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.51 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.51 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.51 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  56.54 
 
 		 268 aa  281  9e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.51 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.51 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  55.83 
 
 		 283 aa  280  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  57.26 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0442  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.41 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  56.25 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  58.9 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1152  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.41 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  60.34 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  58.9 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0506  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  61.41 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.503338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4313  ABC transporter related  55.04 
 
 		 251 aa  279  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  58.65 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  56.85 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  56.85 
 
 		 249 aa  278  4e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  58.9 
 
 		 260 aa  278  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  56.85 
 
 		 249 aa  278  4e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  56.85 
 
 		 241 aa  278  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  56.85 
 
 		 241 aa  278  6e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  58.47 
 
 		 258 aa  278  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  55.36 
 
 		 333 aa  278  6e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  56.85 
 
 		 265 aa  278  8e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  56.43 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  55.97 
 
 		 264 aa  277  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 258 aa  277  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 258 aa  277  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 258 aa  277  9e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 258 aa  277  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 258 aa  277  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 258 aa  277  9e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  58.47 
 
 		 258 aa  277  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  55.65 
 
 		 316 aa  277  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  56.43 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  55.23 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  58.05 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  56.17 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  58.05 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  58.05 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  56.5 
 
 		 268 aa  277  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  55.19 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  57.68 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  57.45 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  57.02 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  57.02 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  57.32 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  57.81 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>