More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2634 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  483  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 241 aa  483  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  68.07 
 
 		 241 aa  321  6e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  63.6 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 		 241 aa  311  5.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  60.5 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  61.34 
 
 		 243 aa  310  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  61.16 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  61.16 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  63.03 
 
 		 243 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  62.87 
 
 		 244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  62.61 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  62.61 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  62.87 
 
 		 249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  62.61 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  62.61 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  62.61 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  62.61 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  62.61 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  58.51 
 
 		 244 aa  306  3e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  59.41 
 
 		 241 aa  306  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  60.17 
 
 		 240 aa  305  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  64.71 
 
 		 241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  59 
 
 		 241 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  60.76 
 
 		 240 aa  305  6e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  62.45 
 
 		 268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  58.51 
 
 		 244 aa  301  5.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  60.34 
 
 		 250 aa  301  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 241 aa  301  7.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  60.92 
 
 		 243 aa  301  9e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  58.09 
 
 		 244 aa  300  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  59.66 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 246 aa  299  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  59 
 
 		 241 aa  299  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  56.85 
 
 		 244 aa  299  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  57.63 
 
 		 244 aa  298  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  59.24 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  61.6 
 
 		 253 aa  298  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  62.61 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  59.24 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  57.74 
 
 		 241 aa  298  6e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  61.32 
 
 		 243 aa  297  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  61.76 
 
 		 243 aa  297  8e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  59.24 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  60.67 
 
 		 243 aa  297  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  58.82 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  61.6 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  61.6 
 
 		 253 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  56.85 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  62.81 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  60.5 
 
 		 243 aa  296  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  62.55 
 
 		 262 aa  295  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  59.66 
 
 		 241 aa  296  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  57.26 
 
 		 244 aa  295  3e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  61.32 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  59.24 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.24 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  58.4 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.24 
 
 		 241 aa  295  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  59.24 
 
 		 242 aa  295  6e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  57.98 
 
 		 241 aa  294  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  62.81 
 
 		 255 aa  293  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  58.82 
 
 		 246 aa  293  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.82 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.82 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.82 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.82 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.82 
 
 		 241 aa  293  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  55.19 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  56.85 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  56.72 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  62.03 
 
 		 271 aa  293  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  58.23 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 243 aa  292  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4299  ABC transporter-related protein  61.34 
 
 		 255 aa  292  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  58.4 
 
 		 241 aa  291  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  58.4 
 
 		 241 aa  291  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  58.4 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  55.27 
 
 		 243 aa  291  7e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  62.14 
 
 		 263 aa  291  7e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  57.32 
 
 		 254 aa  291  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  60.66 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  58.75 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  61.22 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  61.32 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  60.91 
 
 		 256 aa  289  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  55.46 
 
 		 243 aa  289  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  61.92 
 
 		 239 aa  289  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 		 245 aa  289  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  59.49 
 
 		 247 aa  289  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.24 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.24 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  61.32 
 
 		 268 aa  288  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 		 243 aa  288  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  54.85 
 
 		 246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  59.17 
 
 		 247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.08 
 
 		 241 aa  288  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.98 
 
 		 241 aa  288  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.98 
 
 		 241 aa  287  9e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>