More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0304 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 263 aa  528  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  92.48 
 
 		 266 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  86.1 
 
 		 262 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  86.1 
 
 		 262 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  89.39 
 
 		 262 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  81.67 
 
 		 255 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  79.53 
 
 		 255 aa  401  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  78.41 
 
 		 261 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  78.79 
 
 		 261 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  80.4 
 
 		 258 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  80.4 
 
 		 258 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  80.4 
 
 		 258 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  80.4 
 
 		 258 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  81.2 
 
 		 260 aa  394  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  80.4 
 
 		 258 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  81.2 
 
 		 258 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  80.4 
 
 		 258 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  80.4 
 
 		 258 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  80.4 
 
 		 258 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  80.4 
 
 		 258 aa  391  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  80.4 
 
 		 258 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  80.4 
 
 		 258 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  80 
 
 		 258 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  80 
 
 		 258 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  80 
 
 		 258 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  72.41 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  73.88 
 
 		 262 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  70.08 
 
 		 264 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  69.58 
 
 		 268 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  72.65 
 
 		 265 aa  359  3e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  73.64 
 
 		 263 aa  358  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  70.52 
 
 		 256 aa  355  5e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  68.7 
 
 		 268 aa  348  7e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  72.76 
 
 		 251 aa  345  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  69.77 
 
 		 268 aa  344  8e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  70.49 
 
 		 244 aa  343  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  72.24 
 
 		 255 aa  343  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  72.24 
 
 		 250 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  66.8 
 
 		 240 aa  333  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  68.03 
 
 		 240 aa  332  4e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  70.9 
 
 		 240 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  65.7 
 
 		 239 aa  315  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  61.09 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  60.15 
 
 		 283 aa  308  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  64.75 
 
 		 241 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  60.55 
 
 		 289 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  62.81 
 
 		 290 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  62.81 
 
 		 289 aa  305  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  64.05 
 
 		 282 aa  305  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  59.43 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  58.87 
 
 		 246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  60.25 
 
 		 241 aa  301  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  63.37 
 
 		 241 aa  302  5.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  59.02 
 
 		 241 aa  301  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  59.02 
 
 		 241 aa  301  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  59.84 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  58.61 
 
 		 241 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  61.94 
 
 		 247 aa  300  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  59.84 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  59.04 
 
 		 241 aa  298  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 		 241 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  56.98 
 
 		 261 aa  298  8e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  62.06 
 
 		 263 aa  297  9e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  55.39 
 
 		 265 aa  298  9e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  59.43 
 
 		 241 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  60.08 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  58.08 
 
 		 311 aa  296  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  61.07 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  61.07 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  58.06 
 
 		 271 aa  296  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  58.23 
 
 		 241 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.02 
 
 		 241 aa  295  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.23 
 
 		 241 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  59.59 
 
 		 250 aa  296  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  59.43 
 
 		 241 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.02 
 
 		 241 aa  295  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0973  ABC transporter related  61 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.156124  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  58.68 
 
 		 265 aa  295  5e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  61.98 
 
 		 240 aa  295  5e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  58.68 
 
 		 241 aa  295  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.5 
 
 		 336 aa  294  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  61.13 
 
 		 239 aa  294  8e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  58.44 
 
 		 243 aa  294  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  60.98 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  61.57 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  57.03 
 
 		 310 aa  292  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  57.75 
 
 		 332 aa  292  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  58.69 
 
 		 317 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  60.49 
 
 		 243 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  60.49 
 
 		 243 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  60.49 
 
 		 243 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  60.49 
 
 		 243 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  58.3 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  57.79 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  60.17 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  58.78 
 
 		 316 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  60.08 
 
 		 243 aa  289  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  60.08 
 
 		 243 aa  289  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>