More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1443 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1443  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000394944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1262  ABC transporter related  53.39 
 
 		 245 aa  266  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000313912  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  47.7 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 241 aa  240  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0645  ABC transporter related  45.42 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1372  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00133001  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.28 
 
 		 256 aa  231  7.000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0815  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 		 247 aa  228  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1462  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 245 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1227  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.69 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0707636  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1890  ABC transporter related  45.76 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.670859  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1924  ABC transporter related  45.76 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0963  ABC transporter related  42.5 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1084  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  42.5 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1152  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  42.5 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1213  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  42.5 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0979  ABC transporter ATP-binding protein EcsA  42.5 
 
 		 247 aa  224  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1048  ABC transporter ATP-binding protein  42.5 
 
 		 247 aa  224  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4220  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  42.5 
 
 		 247 aa  224  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.183421  normal  0.0669124 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0968  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0958  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1125  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  42.08 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1274  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.27 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2498  ABC transporter related  39.06 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2052  ABC transporter related  38.3 
 
 		 240 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2073  ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.547157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2228  ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2212  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1634  ABC transporter-related protein  38.56 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00322999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  35.74 
 
 		 237 aa  148  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2256  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.19395e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2012  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0763629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2011  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2258  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  36.7 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2340  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.711037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  31.91 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.25 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  31.91 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  31.91 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  34.55 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 		 241 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 		 241 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  31.53 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  34.7 
 
 		 258 aa  141  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  34.09 
 
 		 259 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1742  ABC transporter-related protein  35.16 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.6629  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  34.53 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  31.49 
 
 		 241 aa  138  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  30.57 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  31.36 
 
 		 256 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  32.61 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  31.49 
 
 		 244 aa  135  8e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  30.77 
 
 		 240 aa  135  8e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 293 aa  134  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  32.74 
 
 		 257 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  31.06 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0682  ABC transporter related  37.02 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  31.06 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  34.53 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  31.65 
 
 		 344 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  32.29 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  31.53 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  32.9 
 
 		 316 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.62 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  35.59 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  33.63 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  30.62 
 
 		 315 aa  131  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  33.79 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  34.23 
 
 		 302 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  31.65 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  34.45 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  33.48 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  30.63 
 
 		 308 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  32.89 
 
 		 340 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  31.4 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  30.45 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  29.88 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  34.55 
 
 		 298 aa  128  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  31.36 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  30.94 
 
 		 247 aa  128  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  29.69 
 
 		 301 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  33.6 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  31.08 
 
 		 297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  32.88 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  30.62 
 
 		 369 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  33.04 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  31.53 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  31.16 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  29.86 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3333  ABC transporter related  34.12 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 		 309 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>