More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1262 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1262  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  502  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000313912  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  60.42 
 
 		 243 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.5 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 241 aa  299  2e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0645  ABC transporter related  57.98 
 
 		 245 aa  293  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0815  ABC transporter-related protein  55.88 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1890  ABC transporter related  53.94 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.670859  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1924  ABC transporter related  53.94 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717328  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1372  ABC transporter, ATP-binding protein  53.11 
 
 		 246 aa  289  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00133001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1084  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  55.04 
 
 		 247 aa  288  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1152  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  55.04 
 
 		 247 aa  286  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0968  ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 		 247 aa  286  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0979  ABC transporter ATP-binding protein EcsA  55.04 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1048  ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4220  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  55.04 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.183421  normal  0.0669124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0963  ABC transporter related  54.2 
 
 		 247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0958  ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 		 247 aa  285  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1125  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  54.62 
 
 		 247 aa  285  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1213  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  54.62 
 
 		 247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1462  ABC transporter related protein  55.83 
 
 		 245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1443  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.39 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000394944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1274  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.42 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1227  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.49 
 
 		 246 aa  252  3e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0707636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  41.84 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2498  ABC transporter related  40.93 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2073  ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.547157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2228  ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2340  ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.711037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2258  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 236 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1634  ABC transporter-related protein  41.74 
 
 		 257 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00322999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2256  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 236 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.19395e-27 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2052  ABC transporter related  42.17 
 
 		 240 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2012  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0763629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2011  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2212  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  38.2 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  36.21 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  38.4 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  35.71 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  34.43 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  34.32 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3333  ABC transporter related  36.67 
 
 		 236 aa  158  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  34.17 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  35.4 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  36.21 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  35.4 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  34.19 
 
 		 249 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  35.81 
 
 		 242 aa  155  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  33.61 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  35.86 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  34.55 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  34.25 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  31.49 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  33.2 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  33.88 
 
 		 241 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.07 
 
 		 312 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  34.19 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.65 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  32.76 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  33.19 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1477  ABC transporter related  37.13 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  33.79 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  34.4 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.67 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  33.64 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  36.16 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1742  ABC transporter-related protein  33.49 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.6629  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  33.94 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  35.81 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  35.71 
 
 		 332 aa  145  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  36.82 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  32.13 
 
 		 369 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  32.5 
 
 		 272 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  33.94 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 541 aa  144  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  33.94 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 		 312 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 		 312 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.64 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  31.67 
 
 		 512 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>