More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0087 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  100 
 
 
341 aa  686    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  49.68 
 
 
344 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  48.04 
 
 
319 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  48.21 
 
 
320 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  48.21 
 
 
320 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  45.28 
 
 
331 aa  272  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  44.27 
 
 
328 aa  272  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  40.3 
 
 
369 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  44.19 
 
 
311 aa  267  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  41.77 
 
 
315 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  43.41 
 
 
360 aa  258  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
336 aa  253  3e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  40.82 
 
 
317 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  39.05 
 
 
325 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  40.13 
 
 
310 aa  245  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  40.33 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  42.62 
 
 
322 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  43.04 
 
 
308 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  43.51 
 
 
329 aa  236  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  42.07 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  51.14 
 
 
236 aa  228  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  39.05 
 
 
315 aa  228  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  42.11 
 
 
305 aa  226  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  47.93 
 
 
305 aa  222  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.74 
 
 
301 aa  221  9e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  46.82 
 
 
303 aa  222  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  40.84 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  38.26 
 
 
298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  36.45 
 
 
308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  37.46 
 
 
316 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  44.92 
 
 
323 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 
314 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  45.02 
 
 
235 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  37.86 
 
 
331 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  37.3 
 
 
308 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  37.1 
 
 
299 aa  202  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  36.96 
 
 
314 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  36.66 
 
 
308 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  39.17 
 
 
307 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  40.89 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  38.66 
 
 
317 aa  199  7.999999999999999e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  36.01 
 
 
308 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  46.4 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 
311 aa  196  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 
309 aa  195  1e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
312 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  47 
 
 
307 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
261 aa  192  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  39.16 
 
 
306 aa  192  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.62 
 
 
307 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  36.25 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  45.41 
 
 
339 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  38.93 
 
 
316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  45.62 
 
 
247 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  38.71 
 
 
305 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  39.16 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  35.38 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  34.86 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  32.59 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.62 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  41.26 
 
 
510 aa  179  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  33.76 
 
 
309 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  36.16 
 
 
303 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  37.34 
 
 
326 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
328 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  36.28 
 
 
305 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  32.69 
 
 
309 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  33.85 
 
 
328 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  40.69 
 
 
289 aa  176  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  32.31 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  35.52 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.13 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  40.87 
 
 
306 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.23 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.95 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  33.12 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  35.76 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  34.64 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.94 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  40.79 
 
 
332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.53 
 
 
343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  38.87 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  33.02 
 
 
318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  34.15 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.91 
 
 
245 aa  173  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  35.03 
 
 
314 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  38.46 
 
 
293 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  41.26 
 
 
512 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  34.09 
 
 
300 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  41.44 
 
 
253 aa  172  7.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  35.97 
 
 
333 aa  172  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  34.89 
 
 
339 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.2 
 
 
312 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  34.89 
 
 
339 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.81 
 
 
411 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  36.68 
 
 
339 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5657  ABC transporter related protein  43.3 
 
 
258 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.893177  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.63 
 
 
324 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  39.47 
 
 
337 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>