More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5657 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5657  ABC transporter related protein  100 
 
 
258 aa  484  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.893177  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  42.08 
 
 
310 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  41.01 
 
 
369 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  40.83 
 
 
236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  43.3 
 
 
341 aa  194  9e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  42.17 
 
 
319 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  42.53 
 
 
317 aa  191  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  40.87 
 
 
311 aa  191  9e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  42.18 
 
 
315 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  40.55 
 
 
325 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.72 
 
 
301 aa  190  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  40.35 
 
 
315 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  40.57 
 
 
316 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  39.76 
 
 
311 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  43.5 
 
 
331 aa  186  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  39.45 
 
 
336 aa  186  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  38.91 
 
 
317 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  41.63 
 
 
320 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  41.63 
 
 
320 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  42.41 
 
 
331 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  44.5 
 
 
344 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  39.44 
 
 
298 aa  183  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  45.25 
 
 
329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  37.56 
 
 
308 aa  181  7e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  36.82 
 
 
305 aa  181  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  40.08 
 
 
240 aa  181  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  40.27 
 
 
328 aa  181  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  44.29 
 
 
247 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 
309 aa  179  2.9999999999999997e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  38.18 
 
 
306 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  40.27 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  41.31 
 
 
261 aa  179  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  42.2 
 
 
308 aa  178  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  38.91 
 
 
299 aa  177  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  45.37 
 
 
325 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  39.35 
 
 
310 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  41.63 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  42.6 
 
 
332 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  41.07 
 
 
298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 
307 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  38.91 
 
 
360 aa  172  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  35.45 
 
 
303 aa  171  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  38.81 
 
 
305 aa  171  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  36.63 
 
 
317 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  40.38 
 
 
308 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
312 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
308 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  38.19 
 
 
307 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  35.56 
 
 
235 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  38.94 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  43.59 
 
 
332 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  34.29 
 
 
253 aa  163  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  43.44 
 
 
305 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  33.63 
 
 
323 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  39.29 
 
 
293 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  40.45 
 
 
306 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
317 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.54 
 
 
314 aa  158  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
307 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  36.86 
 
 
297 aa  158  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  40.47 
 
 
305 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  37.3 
 
 
249 aa  157  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  37.04 
 
 
323 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  41.85 
 
 
323 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  35.02 
 
 
272 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  38.81 
 
 
323 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.08 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  35.59 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  40.57 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  40.85 
 
 
346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.21 
 
 
256 aa  152  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  34.82 
 
 
303 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  40.19 
 
 
287 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  37.67 
 
 
306 aa  152  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2229  ABC transporter related  42.74 
 
 
233 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  42.54 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  35.52 
 
 
279 aa  152  7e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
248 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  31.75 
 
 
247 aa  151  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  37.08 
 
 
340 aa  151  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  35.32 
 
 
314 aa  151  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  34.23 
 
 
308 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  36.2 
 
 
296 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  39.01 
 
 
316 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  35.42 
 
 
257 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  37.56 
 
 
314 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  39.2 
 
 
253 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  31.88 
 
 
308 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  39.82 
 
 
316 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  33.19 
 
 
308 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  39.23 
 
 
311 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  34.98 
 
 
316 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  37.39 
 
 
328 aa  149  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  36.41 
 
 
308 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 
350 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  39.17 
 
 
244 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>