More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3598 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3598  ABC transporter related  100 
 
 
281 aa  570  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5375  ABC transporter, ATP-binding protein  49.28 
 
 
280 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214452 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5409  ABC transporter, ATP-binding protein  49.28 
 
 
280 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00615205  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5133  ABC transporter ATP-binding protein  49.28 
 
 
280 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.907732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4966  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  49.28 
 
 
280 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000075672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4984  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  49.28 
 
 
280 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201825  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5526  ABC transporter ATP-binding protein  49.28 
 
 
280 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5460  ABC transporter, ATP-binding protein  48.92 
 
 
280 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00101212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5545  ABC transporter, ATP-binding protein  48.92 
 
 
280 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5082  ABC transporter related  49.28 
 
 
280 aa  268  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5405  ABC transporter, ATP-binding protein  48.56 
 
 
280 aa  267  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00980275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3803  ABC transporter-related protein  48.56 
 
 
281 aa  264  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  41.16 
 
 
290 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  40.99 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  40.99 
 
 
288 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  40.28 
 
 
287 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03720  ABC transporter related  40.85 
 
 
284 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  39.13 
 
 
285 aa  199  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2202  ABC transporter related  40.52 
 
 
312 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2248  ABC transporter related  40.52 
 
 
312 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2191  ABC transporter related  40.52 
 
 
312 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0278805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0970  ABC transporter related  37.54 
 
 
283 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.653003 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  37.76 
 
 
282 aa  192  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3832  ABC transporter related  38.16 
 
 
283 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363702  hitchhiker  0.000120659 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.29 
 
 
318 aa  189  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2001  ABC transporter related  38.55 
 
 
286 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.5 
 
 
318 aa  187  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4683  ABC transporter related protein  37.41 
 
 
287 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192563  normal  0.0676075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0776  ABC transporter-related protein  38.01 
 
 
290 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  39 
 
 
251 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.13 
 
 
279 aa  185  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12703  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  38.81 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.51 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 
334 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  33.44 
 
 
308 aa  183  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.85 
 
 
317 aa  182  6e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  32.78 
 
 
741 aa  181  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  38.29 
 
 
314 aa  181  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 
306 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  41.36 
 
 
306 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  36.94 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  35.62 
 
 
327 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  35.96 
 
 
300 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  41.82 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  37.89 
 
 
283 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.1 
 
 
312 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.46 
 
 
343 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.31 
 
 
328 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.36 
 
 
321 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.96 
 
 
316 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  32.56 
 
 
333 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  40.53 
 
 
275 aa  175  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.99 
 
 
328 aa  175  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.88 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36 
 
 
323 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.01 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  33.22 
 
 
310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  33.55 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5589  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.53 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  32.57 
 
 
308 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.55 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  40.37 
 
 
314 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.66 
 
 
311 aa  171  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.66 
 
 
316 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1678  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
284 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
310 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  33.66 
 
 
304 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  39.27 
 
 
331 aa  171  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.47 
 
 
317 aa  171  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.64 
 
 
324 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  34.23 
 
 
328 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  33.93 
 
 
285 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  35.89 
 
 
307 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35 
 
 
322 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  34.13 
 
 
301 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  34.97 
 
 
291 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.68 
 
 
305 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.86 
 
 
330 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.87 
 
 
325 aa  169  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  32.56 
 
 
320 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  39.73 
 
 
305 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  32.9 
 
 
308 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  37.16 
 
 
319 aa  168  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4353  ABC transporter related  40.28 
 
 
340 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0121046  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.67 
 
 
324 aa  168  9e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  33.85 
 
 
328 aa  168  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 
356 aa  168  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  33.11 
 
 
300 aa  168  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  31.07 
 
 
312 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1472  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  31.48 
 
 
371 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.269585 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.01 
 
 
305 aa  167  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.57 
 
 
317 aa  167  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  35.23 
 
 
319 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  31.39 
 
 
312 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  37.16 
 
 
319 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  36.65 
 
 
314 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  31.39 
 
 
312 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  31.39 
 
 
312 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>