More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4353 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4353  ABC transporter related  100 
 
 		 340 aa  681    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0121046  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  49.25 
 
 		 331 aa  285  8e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  44.55 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  42.06 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  41.98 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  44.21 
 
 		 288 aa  192  7e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  44.88 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  43.41 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  37.65 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  39.58 
 
 		 290 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  46.22 
 
 		 250 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  34.74 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  44.05 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  42.97 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  36.84 
 
 		 318 aa  185  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 306 aa  185  9e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.55 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2704  ABC transporter related  45.5 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  37.27 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  36.2 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4966  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 		 280 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000075672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4984  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  43.72 
 
 		 280 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5375  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 280 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214452 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5409  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00615205  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5545  ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5460  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00101212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5082  ABC transporter related  45.45 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.08 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5405  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 280 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00980275  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  40.34 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  40 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5133  ABC transporter ATP-binding protein  43.26 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.907732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5526  ABC transporter ATP-binding protein  43.26 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3803  ABC transporter-related protein  44.95 
 
 		 281 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  37.35 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  40.17 
 
 		 248 aa  179  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  43.95 
 
 		 582 aa  179  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  39.38 
 
 		 319 aa  179  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  35.49 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  34.81 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.17 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  46.12 
 
 		 279 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  42.22 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  39.37 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 319 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  44.75 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  43.72 
 
 		 510 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  35.35 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.65 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  42.41 
 
 		 512 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 251 aa  176  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  40.53 
 
 		 580 aa  175  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  44.28 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 		 580 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  40.08 
 
 		 256 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  44.25 
 
 		 593 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  41.96 
 
 		 580 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  37.11 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  40.17 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.29 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0523  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000509478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  33.54 
 
 		 326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  39.09 
 
 		 241 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  46.27 
 
 		 578 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.38 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.55 
 
 		 913 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 1171 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  34.55 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  39.06 
 
 		 576 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  39.65 
 
 		 580 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  40.89 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  41.99 
 
 		 585 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  45.7 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  38.37 
 
 		 741 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  42.51 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  41.26 
 
 		 579 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  43.17 
 
 		 917 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  48.45 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  44.25 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  40.53 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  35.83 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  42.6 
 
 		 585 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  31.82 
 
 		 300 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  37.02 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  34.94 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  43.81 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  35.37 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  34.46 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  38.91 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  43.38 
 
 		 582 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  46.53 
 
 		 590 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.94 
 
 		 339 aa  169  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3231  ABC transporter-related protein  31.82 
 
 		 312 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 578 aa  169  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  44 
 
 		 575 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 578 aa  169  9e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 578 aa  168  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>