More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01818 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01818  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
245 aa  490  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000012979  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0682  ABC transporter related  51.98 
 
 
231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  48.9 
 
 
231 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5321  ABC transporter related  51.52 
 
 
234 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3361  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.28 
 
 
239 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  47.37 
 
 
236 aa  202  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3773  ABC transporter related  44.21 
 
 
245 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4461  ABC transporter related  50.7 
 
 
273 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0398264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3610  ABC transporter ATP-binding protein  44.92 
 
 
249 aa  192  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000141343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01807  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 
240 aa  185  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04085  ABC transporter ATP-binding protein  47.8 
 
 
240 aa  178  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.55 
 
 
309 aa  151  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  37.24 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  34.84 
 
 
318 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  37.5 
 
 
242 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  36 
 
 
337 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.89 
 
 
316 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  38.29 
 
 
309 aa  142  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  44.13 
 
 
298 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  33.94 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  32.02 
 
 
308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  36.89 
 
 
292 aa  138  6e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  36.24 
 
 
340 aa  138  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  37.61 
 
 
252 aa  138  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  40.38 
 
 
253 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  42.55 
 
 
304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  38.97 
 
 
279 aa  135  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  45.54 
 
 
304 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  40.82 
 
 
332 aa  135  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  41.97 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  38.43 
 
 
300 aa  135  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  42.78 
 
 
322 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  41 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  38.07 
 
 
250 aa  133  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.35 
 
 
312 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  39.66 
 
 
308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  37.91 
 
 
316 aa  132  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  41.1 
 
 
299 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.93 
 
 
299 aa  132  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  33.19 
 
 
236 aa  132  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4762  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.22 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000635501  hitchhiker  0.0000711162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  37.55 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  35.45 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  35.23 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  34.86 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  37.85 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  40.57 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 
310 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  37.67 
 
 
310 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  33.89 
 
 
298 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  37.67 
 
 
310 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  35.77 
 
 
318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
316 aa  128  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  37.56 
 
 
346 aa  128  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  40.48 
 
 
348 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 
303 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  43.01 
 
 
344 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  36.62 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  33.33 
 
 
303 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  32.91 
 
 
303 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  35.41 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  37.29 
 
 
309 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.49 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  32.49 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  32.49 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  32.49 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  36.19 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  43.32 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  33.94 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  37.28 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  35.51 
 
 
303 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  36.62 
 
 
310 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  40 
 
 
348 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  40 
 
 
348 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  37.44 
 
 
323 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  32.49 
 
 
303 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  35.85 
 
 
318 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  33.33 
 
 
300 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  37.34 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  40.89 
 
 
307 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  40.89 
 
 
307 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
302 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  35.34 
 
 
310 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  36.79 
 
 
318 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  37.68 
 
 
310 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  35.68 
 
 
309 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  34.8 
 
 
303 aa  123  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 
306 aa  122  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  40 
 
 
249 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
266 aa  122  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  37.1 
 
 
261 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  32.43 
 
 
301 aa  122  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
302 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  33.8 
 
 
304 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5490  ABC transporter related  31.6 
 
 
301 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.691656  normal  0.086802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  40.39 
 
 
307 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1477  ABC transporter related  29.96 
 
 
262 aa  122  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>