More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3361 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3361  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 239 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5321  ABC transporter related  56.22 
 
 		 234 aa  264  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0682  ABC transporter related  56.09 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  54.78 
 
 		 231 aa  252  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  51.72 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01818  ABC transporter ATP-binding protein  47.28 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000012979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4461  ABC transporter related  46.49 
 
 		 273 aa  198  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0398264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3610  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 249 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000141343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04085  ABC transporter ATP-binding protein  39.3 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.45 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.38 
 
 		 312 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  37.22 
 
 		 318 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01807  ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 		 240 aa  158  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  37.76 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3773  ABC transporter related  36.68 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  34.51 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.22 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  36.2 
 
 		 305 aa  151  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  35.32 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  36.92 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  34.19 
 
 		 337 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  38.94 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  41.2 
 
 		 309 aa  148  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  35.65 
 
 		 303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  37.13 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  39.15 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.07 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  36.93 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  36.62 
 
 		 309 aa  145  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  37.25 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  35.81 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  41.67 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  38.92 
 
 		 306 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  40.38 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  37.44 
 
 		 512 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  37.1 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  36.28 
 
 		 340 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  34.75 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  34.82 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  36.79 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  35.83 
 
 		 312 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  36.79 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  37.33 
 
 		 747 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  34.39 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  34.91 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  39.44 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  34.93 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  35.1 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  36.06 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  37.85 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  36.09 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  37.16 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  38.54 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  38.86 
 
 		 322 aa  138  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  40.59 
 
 		 331 aa  138  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  41.46 
 
 		 318 aa  138  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.22 
 
 		 304 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.51 
 
 		 317 aa  137  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  36.24 
 
 		 314 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  37.68 
 
 		 308 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  35.98 
 
 		 293 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  39.02 
 
 		 307 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  39.02 
 
 		 307 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  38.68 
 
 		 304 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  35.61 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  36.89 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  30.83 
 
 		 241 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.29 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  32.2 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  36.87 
 
 		 310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  39.61 
 
 		 301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  32.14 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  34.84 
 
 		 301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  36.87 
 
 		 310 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.6 
 
 		 316 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  37.21 
 
 		 313 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.44 
 
 		 317 aa  135  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  35.92 
 
 		 319 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 304 aa  135  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.7 
 
 		 317 aa  135  5e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  38.79 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  35.07 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  38.24 
 
 		 302 aa  134  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  37.75 
 
 		 249 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 		 331 aa  134  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.03 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  34.91 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  39.82 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  35.65 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2058  ABC transporter, ATPase subunit  31.28 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  33.8 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  38.54 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>