More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4461 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4461  ABC transporter related  100 
 
 		 273 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0398264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04085  ABC transporter ATP-binding protein  60.52 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3773  ABC transporter related  48.72 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  46.51 
 
 		 231 aa  209  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0682  ABC transporter related  44.93 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3610  ABC transporter ATP-binding protein  46.44 
 
 		 249 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000141343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5321  ABC transporter related  46.7 
 
 		 234 aa  202  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3361  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.49 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01807  ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  46.05 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01818  ABC transporter ATP-binding protein  50.7 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000012979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  43.63 
 
 		 316 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  40.65 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  40.49 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  43.63 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  42.16 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  43.72 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.19 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  40.55 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  39.81 
 
 		 344 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  39.25 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  41.23 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  37.09 
 
 		 340 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  46.45 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  46.7 
 
 		 304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3013  ABC transporter related  37.95 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  41.38 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  37.22 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  41.79 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  38.16 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.64 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  37.5 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  41.06 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  39.56 
 
 		 348 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  40.76 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  39.56 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  40.55 
 
 		 328 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2017  ABC transporter related  40.65 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  40.19 
 
 		 348 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  40.89 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  40.1 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  37.39 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  38.57 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  40.7 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  40 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00330  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.64 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851117  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  38.64 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  39.41 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  33.97 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  33.64 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  39.17 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  41.12 
 
 		 302 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 332 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  34.5 
 
 		 303 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.44 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.139774  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  37.44 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  35.55 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  37.19 
 
 		 316 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0523  ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 		 368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000509478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1708  ABC transporter related  41.88 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249646  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  39.02 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  37.31 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  39.9 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  40.38 
 
 		 326 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 		 304 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  39.11 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  38.84 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  39.81 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  38.84 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  41.15 
 
 		 342 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  39.6 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2338  ABC transporter-like protein  40.09 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  36.61 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  40.09 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  37.62 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.12 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.04 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 308 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  39.59 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  39.59 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4132  ABC transporter related  37.5 
 
 		 328 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  37 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  37.13 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  36 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.83 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  36.67 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  39.11 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  38.39 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  36.4 
 
 		 345 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  40.1 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  36.4 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  37.11 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  36.22 
 
 		 244 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  35.29 
 
 		 318 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>