More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3330 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  100 
 
 
231 aa  465  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0682  ABC transporter related  77.49 
 
 
231 aa  360  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5321  ABC transporter related  61.57 
 
 
234 aa  289  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  55.65 
 
 
236 aa  258  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3361  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.78 
 
 
239 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01818  ABC transporter ATP-binding protein  48.9 
 
 
245 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000012979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4461  ABC transporter related  46.51 
 
 
273 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0398264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3610  ABC transporter ATP-binding protein  42.49 
 
 
249 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000141343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3773  ABC transporter related  42.86 
 
 
245 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01807  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04085  ABC transporter ATP-binding protein  40.27 
 
 
240 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  39.65 
 
 
318 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  40.85 
 
 
303 aa  174  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.26 
 
 
337 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  37.74 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.71 
 
 
309 aa  162  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  37.75 
 
 
332 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  39.6 
 
 
303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.79 
 
 
316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  41.51 
 
 
298 aa  161  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  37.13 
 
 
252 aa  160  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  38.79 
 
 
301 aa  160  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  40 
 
 
318 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  36.12 
 
 
303 aa  159  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  38.35 
 
 
346 aa  158  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  36.32 
 
 
305 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
310 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  36.49 
 
 
293 aa  156  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  36.32 
 
 
308 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.13 
 
 
259 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  37.2 
 
 
316 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.55 
 
 
312 aa  154  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  36.97 
 
 
310 aa  154  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.71 
 
 
309 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  38.1 
 
 
313 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  36.71 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  33.82 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  35.93 
 
 
279 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  38.74 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  36.97 
 
 
252 aa  152  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  35.53 
 
 
250 aa  152  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  37.84 
 
 
328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32.91 
 
 
311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
310 aa  151  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 
312 aa  151  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  36.71 
 
 
335 aa  151  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  33.76 
 
 
312 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
312 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  36.78 
 
 
512 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 
312 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 
312 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 
312 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
312 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 
312 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 
312 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
312 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  35.38 
 
 
303 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  34.89 
 
 
250 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  38.57 
 
 
270 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  34.89 
 
 
250 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  34.15 
 
 
301 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  37.62 
 
 
344 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  34.76 
 
 
300 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  37.97 
 
 
257 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  36.54 
 
 
316 aa  148  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 
309 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  37.77 
 
 
250 aa  148  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  38.76 
 
 
298 aa  148  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 
304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  37.56 
 
 
340 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  33.94 
 
 
307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  34.43 
 
 
323 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 
304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  37.02 
 
 
314 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  35.06 
 
 
246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  35.22 
 
 
300 aa  146  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.54 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  34.6 
 
 
249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  35.24 
 
 
295 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  36.71 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  35.62 
 
 
747 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  36.32 
 
 
318 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  33.2 
 
 
245 aa  146  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  37.61 
 
 
242 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  36.32 
 
 
318 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  35 
 
 
328 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.29 
 
 
317 aa  146  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  35.24 
 
 
311 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  35.29 
 
 
309 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  36.49 
 
 
313 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  36.76 
 
 
310 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  37.44 
 
 
304 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  34.86 
 
 
327 aa  145  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  36.92 
 
 
241 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  35.65 
 
 
302 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  33.81 
 
 
298 aa  145  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  35.61 
 
 
300 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  33.19 
 
 
247 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>