More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3402 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 322 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  67.43 
 
 		 327 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  63.61 
 
 		 303 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  62.38 
 
 		 304 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  51.85 
 
 		 308 aa  301  9e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  51.69 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  48.4 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  49.67 
 
 		 304 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  49.34 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  42.76 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  44.44 
 
 		 301 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  43.43 
 
 		 325 aa  249  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  44.48 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  42.57 
 
 		 301 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  43.64 
 
 		 327 aa  242  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  44.56 
 
 		 302 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  46.55 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  46.71 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  44.33 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  46.76 
 
 		 299 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  46.42 
 
 		 298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43.19 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  41.72 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.76 
 
 		 316 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  48.95 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  48.95 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  41.83 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  42.16 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  41.55 
 
 		 310 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  41.55 
 
 		 310 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  47.62 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 332 aa  229  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  40.25 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  41.31 
 
 		 306 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  49.54 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  46.81 
 
 		 314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  41.23 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  41.23 
 
 		 345 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  41.78 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  43.05 
 
 		 309 aa  222  8e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 747 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  45.92 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  38.1 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  39.64 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  41.7 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  40.69 
 
 		 337 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  44.71 
 
 		 318 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  44.23 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  40.81 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  42.4 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  35.1 
 
 		 373 aa  178  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  42.65 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  42.79 
 
 		 339 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 311 aa  173  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 322 aa  172  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  37.83 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 356 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  34.58 
 
 		 332 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 310 aa  172  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  35.37 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  36.73 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.64 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.88 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  36.32 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  37.14 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.14 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  37.14 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  37.14 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  37.39 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  38.81 
 
 		 250 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  40.61 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  41.74 
 
 		 326 aa  168  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  41.5 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  40.54 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  36.59 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  37.96 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  32.44 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  37.55 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  41.71 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  42.73 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  39 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  39 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  39.73 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  34.8 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  39.57 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  37.93 
 
 		 326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  39.01 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  37.45 
 
 		 350 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  33.22 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>