More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0356 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 309 aa  623  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  54 
 
 		 300 aa  324  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  54.7 
 
 		 327 aa  322  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  56 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  51.88 
 
 		 325 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  52.56 
 
 		 302 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  50.52 
 
 		 302 aa  300  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  49.29 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  47.35 
 
 		 348 aa  248  9e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  49.29 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  47.57 
 
 		 332 aa  245  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  45.54 
 
 		 344 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  42.52 
 
 		 303 aa  231  9e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  44.58 
 
 		 345 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  46.05 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  43.45 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  43.05 
 
 		 322 aa  222  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  50 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 		 304 aa  212  7e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  40.89 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  37.25 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  38.36 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  39.39 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  39.39 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  37.06 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  35.43 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  41.33 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  42.19 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  42.52 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  44.44 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  48 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  43.56 
 
 		 301 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  37.79 
 
 		 338 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  37.24 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.61 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  36.18 
 
 		 318 aa  182  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 304 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 304 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  43.3 
 
 		 747 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  33.89 
 
 		 303 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  36.21 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  43.61 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  43.61 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  43.11 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  43.46 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  35.62 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  33.89 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  35.62 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  32.12 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  35.16 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 		 312 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  34.7 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 311 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  38.26 
 
 		 250 aa  155  9e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  39.23 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  36.32 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  37.05 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  29.8 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  36.24 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  33.78 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  36 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  34.68 
 
 		 373 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.28 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  31.16 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  35.6 
 
 		 305 aa  145  9e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  37.07 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  37.07 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  36.21 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  33.48 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  36.21 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  32.82 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.32 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  38.94 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  36.21 
 
 		 304 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  38.94 
 
 		 318 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  33.67 
 
 		 320 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  35.29 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  36.24 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  34.82 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  39.09 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  39.8 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  37.16 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  32.42 
 
 		 390 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  36.61 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  34.53 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  36.03 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>