More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1559 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1559  ABC transporter related  100 
 
 
299 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0776966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1464  ABC transporter-related protein  98.66 
 
 
299 aa  554  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2399  ABC transporter, ATPase subunit  97.66 
 
 
299 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.196934  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0247  ABC transporter related  72.58 
 
 
299 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.702234  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  34.03 
 
 
303 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  40.33 
 
 
309 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  40.48 
 
 
306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  40.72 
 
 
309 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5321  ABC transporter related  41.31 
 
 
234 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  42.11 
 
 
322 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  46.89 
 
 
301 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 
331 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 
316 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  39.41 
 
 
302 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  35.6 
 
 
318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  39.13 
 
 
303 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  42.58 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  38.83 
 
 
301 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  45.19 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  41.63 
 
 
308 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  34.27 
 
 
298 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  44.71 
 
 
298 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  32.57 
 
 
350 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  29.97 
 
 
300 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  37.79 
 
 
310 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  37.56 
 
 
315 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  40.19 
 
 
303 aa  149  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  45.19 
 
 
301 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  39.81 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  39.35 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  40.09 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  37.78 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  29.68 
 
 
311 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.43 
 
 
316 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  39.35 
 
 
318 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  40.28 
 
 
338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  34.23 
 
 
338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  33.01 
 
 
335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  29.37 
 
 
308 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.42 
 
 
312 aa  145  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  45.33 
 
 
342 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  44.34 
 
 
332 aa  145  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  37.8 
 
 
327 aa  145  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  36.24 
 
 
309 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  34.77 
 
 
332 aa  144  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  38.41 
 
 
301 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  38.51 
 
 
331 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  34.44 
 
 
337 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
304 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  33.33 
 
 
338 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  37.98 
 
 
348 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  40.38 
 
 
310 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
309 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
304 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  40.38 
 
 
314 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  39.23 
 
 
311 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  38.89 
 
 
310 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  38.89 
 
 
310 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  33.78 
 
 
338 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  38.15 
 
 
318 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  38.15 
 
 
318 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  41.98 
 
 
747 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  37.98 
 
 
348 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  34.82 
 
 
252 aa  142  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.9 
 
 
304 aa  142  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  35.67 
 
 
301 aa  142  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  37.98 
 
 
348 aa  142  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  32.67 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  29.33 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  39.15 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  36.48 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  41.06 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  33.94 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  34.63 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  34.63 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  34.44 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.63 
 
 
339 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  38.61 
 
 
313 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  31.51 
 
 
316 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  33.18 
 
 
338 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.53 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00330  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.64 
 
 
311 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851117  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  34.22 
 
 
231 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  42.54 
 
 
304 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  37.67 
 
 
339 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  42.54 
 
 
304 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  37.95 
 
 
279 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 
304 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  34.14 
 
 
318 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.71 
 
 
316 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1823  ABC transporter related  34.73 
 
 
309 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.554896  normal  0.879198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  37.73 
 
 
247 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  33.87 
 
 
316 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  36.54 
 
 
336 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  34.91 
 
 
339 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  40.65 
 
 
337 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  37.05 
 
 
313 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  36.84 
 
 
304 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>