More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3411 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  100 
 
 		 342 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  76.87 
 
 		 332 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  46.74 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  46.51 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  45.82 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  44.63 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1807  ABC transporter related  42.81 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  36.64 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  42.14 
 
 		 315 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  44.71 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  45.49 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  41.78 
 
 		 300 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  43.14 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  36.81 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  41.53 
 
 		 326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  43.33 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  35.91 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  44.65 
 
 		 247 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  47.3 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  45.21 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  41.18 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  38.74 
 
 		 301 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  47.08 
 
 		 318 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  35.79 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  47.08 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  45.5 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  43.37 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  36.66 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  39.35 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  38.54 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  37.29 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  40.18 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  45.62 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  39.73 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 313 aa  173  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 335 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  39.37 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  47.93 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  42.25 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  38.36 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2035  ABC transporter, ATP-binding protein  32.24 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0885424  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.92 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  41.31 
 
 		 331 aa  169  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3286  ABC transporter-like  37.96 
 
 		 330 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  34.53 
 
 		 327 aa  169  9e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  38.87 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  40.87 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  32.68 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  32.68 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  38.56 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  41.23 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  44.29 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  43.85 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  47.2 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  32.06 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  42.75 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  41.45 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  34.23 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  31.06 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  33.44 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  33.44 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  42.98 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  41.9 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  35.46 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  32.23 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 		 301 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  36.33 
 
 		 296 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  40.35 
 
 		 305 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  39.13 
 
 		 298 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  46.58 
 
 		 299 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  35.46 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  32.03 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  39.53 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  37.56 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.47 
 
 		 331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  44.93 
 
 		 309 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  32.47 
 
 		 303 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  32.47 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  38.52 
 
 		 346 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  32.47 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  41.15 
 
 		 288 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  33.11 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  33.11 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  42.2 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  32.25 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  38.79 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  40.98 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  43.11 
 
 		 911 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  38.39 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>