More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0439 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  100 
 
 		 283 aa  549  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3013  ABC transporter related  58.27 
 
 		 284 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  65.6 
 
 		 282 aa  342  5e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  44.89 
 
 		 585 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.89 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  47.8 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.48 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  46.25 
 
 		 306 aa  198  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  40.64 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  48.57 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0733  ABC transporter related  47.8 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0344871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  48.89 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  40.93 
 
 		 313 aa  195  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  47.8 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  43.81 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2543  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0189029  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  45.41 
 
 		 581 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2550  ABC transporter related  44.24 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0766214  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.38 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.54 
 
 		 411 aa  192  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  44.79 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  44.76 
 
 		 241 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  48.37 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  46.36 
 
 		 582 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  43.52 
 
 		 324 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  46.05 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.62 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  42.33 
 
 		 580 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  43.24 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 309 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  44.66 
 
 		 332 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  49.08 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  45.87 
 
 		 593 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.28 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  46.36 
 
 		 314 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2506  ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 241 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5638  ABC transporter related  37.87 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2598  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 241 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  46.01 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0695  ABC transporter related protein  44.61 
 
 		 328 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  47.49 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2280  ABC transporter, ATP-binding protein  43.06 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  41.86 
 
 		 580 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  38.81 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  39.73 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1757  ABC transporter related protein  45.75 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  40.19 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2817  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000055969 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2322  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00275185  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.04 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2555  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14155e-24 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  43.98 
 
 		 308 aa  185  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  44.75 
 
 		 576 aa  185  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  43.58 
 
 		 512 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  40.96 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  41.44 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 		 541 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1670  ABC transporter related  43.23 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  40.2 
 
 		 311 aa  183  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  43.24 
 
 		 510 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.79 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  41.59 
 
 		 333 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  37.61 
 
 		 270 aa  183  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 330 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  44.59 
 
 		 593 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2364  ABC transporter ATP-binding protein  42.03 
 
 		 222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  44.25 
 
 		 312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1081  ATPase  45.21 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2541  ABC transporter ATP-binding protein  42.03 
 
 		 222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.534953  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  42.06 
 
 		 594 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  41.44 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  42.6 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 350 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  41.15 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3742  ABC transporter related  44.2 
 
 		 339 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159768 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.27 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  48.1 
 
 		 245 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.73 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  43.13 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2117  ABC transporter related  43.13 
 
 		 244 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.101378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  44.74 
 
 		 310 aa  181  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.44 
 
 		 279 aa  181  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  47.62 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  38.81 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  41.09 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.55 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  42.47 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  42.33 
 
 		 580 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  41.28 
 
 		 582 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  42.86 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  41.22 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  39.91 
 
 		 248 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  40.83 
 
 		 576 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  40.37 
 
 		 580 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  45.19 
 
 		 328 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  41.18 
 
 		 579 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 		 580 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>